Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHY6

ZFP28, Zinc finger protein 28 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFP28Q8NHY6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFP28Q8NHY6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFP28Q8NHY6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFP28Q8NHY6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZFP28Q8NHY6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZFP28Q8NHY6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZFP28Q8NHY6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZFP28Q8NHY6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFP28Q8NHY6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFP28Q8NHY6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFP28Q8NHY6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFP28Q8NHY6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFP28Q8NHY6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFP28Q8NHY6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZFP28Q8NHY6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZFP28Q8NHY6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZFP28Q8NHY6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZFP28Q8NHY6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZFP28Q8NHY6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZFP28Q8NHY6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZFP28Q8NHY6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZFP28Q8NHY6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZFP28Q8NHY6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZFP28Q8NHY6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZFP28Q8NHY6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZFP28Q8NHY6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZFP28Q8NHY6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZFP28Q8NHY6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZFP28Q8NHY6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZFP28Q8NHY6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZFP28Q8NHY6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZFP28Q8NHY6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZFP28Q8NHY6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZFP28Q8NHY6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZFP28Q8NHY6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZFP28Q8NHY6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZFP28Q8NHY6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ZFP28Q8NHY6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZFP28Q8NHY6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZFP28Q8NHY6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZFP28Q8NHY6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZFP28Q8NHY6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZFP28Q8NHY6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZFP28Q8NHY6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZFP28Q8NHY6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZFP28Q8NHY6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZFP28Q8NHY6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZFP28Q8NHY6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZFP28Q8NHY6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZFP28Q8NHY6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZFP28Q8NHY6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZFP28Q8NHY6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZFP28Q8NHY6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZFP28Q8NHY6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZFP28Q8NHY6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZFP28Q8NHY6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZFP28Q8NHY6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZFP28Q8NHY6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZFP28Q8NHY6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZFP28Q8NHY6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZFP28Q8NHY6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZFP28Q8NHY6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZFP28Q8NHY6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZFP28Q8NHY6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZFP28Q8NHY6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZFP28Q8NHY6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZFP28Q8NHY6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZFP28Q8NHY6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZFP28Q8NHY6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZFP28Q8NHY6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZFP28Q8NHY6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZFP28Q8NHY6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZFP28Q8NHY6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZFP28Q8NHY6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZFP28Q8NHY6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZFP28Q8NHY6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZFP28Q8NHY6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZFP28Q8NHY6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZFP28Q8NHY6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZFP28Q8NHY6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZFP28Q8NHY6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZFP28Q8NHY6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZFP28Q8NHY6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZFP28Q8NHY6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZFP28Q8NHY6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZFP28Q8NHY6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZFP28Q8NHY6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZFP28Q8NHY6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZFP28Q8NHY6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZFP28Q8NHY6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZFP28Q8NHY6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZFP28Q8NHY6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZFP28Q8NHY6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZFP28Q8NHY6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZFP28Q8NHY6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZFP28Q8NHY6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZFP28Q8NHY6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZFP28Q8NHY6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZFP28Q8NHY6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ZFP28Q8NHY6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97 ms