Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU8

LINC00116, Uncharacterized protein encoded by LINC00116, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00116Q8NCU8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
LINC00116Q8NCU8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
LINC00116Q8NCU8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LINC00116Q8NCU8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
LINC00116Q8NCU8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
LINC00116Q8NCU8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LINC00116Q8NCU8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LINC00116Q8NCU8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
LINC00116Q8NCU8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
LINC00116Q8NCU8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
LINC00116Q8NCU8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
LINC00116Q8NCU8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
LINC00116Q8NCU8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
LINC00116Q8NCU8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
LINC00116Q8NCU8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
LINC00116Q8NCU8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LINC00116Q8NCU8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
LINC00116Q8NCU8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LINC00116Q8NCU8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LINC00116Q8NCU8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LINC00116Q8NCU8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LINC00116Q8NCU8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
LINC00116Q8NCU8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LINC00116Q8NCU8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
LINC00116Q8NCU8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
LINC00116Q8NCU8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
LINC00116Q8NCU8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LINC00116Q8NCU8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
LINC00116Q8NCU8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
LINC00116Q8NCU8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
LINC00116Q8NCU8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LINC00116Q8NCU8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
LINC00116Q8NCU8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
LINC00116Q8NCU8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
LINC00116Q8NCU8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
LINC00116Q8NCU8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LINC00116Q8NCU8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LINC00116Q8NCU8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
LINC00116Q8NCU8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
LINC00116Q8NCU8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
LINC00116Q8NCU8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
LINC00116Q8NCU8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
LINC00116Q8NCU8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
LINC00116Q8NCU8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LINC00116Q8NCU8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LINC00116Q8NCU8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LINC00116Q8NCU8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC30■■■□□ 2.39
LINC00116Q8NCU8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LINC00116Q8NCU8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
LINC00116Q8NCU8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
LINC00116Q8NCU8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
LINC00116Q8NCU8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
LINC00116Q8NCU8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
LINC00116Q8NCU8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
LINC00116Q8NCU8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LINC00116Q8NCU8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
LINC00116Q8NCU8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
LINC00116Q8NCU8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LINC00116Q8NCU8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
LINC00116Q8NCU8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LINC00116Q8NCU8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LINC00116Q8NCU8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
LINC00116Q8NCU8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
LINC00116Q8NCU8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
LINC00116Q8NCU8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
LINC00116Q8NCU8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LINC00116Q8NCU8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LINC00116Q8NCU8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LINC00116Q8NCU8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LINC00116Q8NCU8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
LINC00116Q8NCU8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
LINC00116Q8NCU8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
LINC00116Q8NCU8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
LINC00116Q8NCU8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
LINC00116Q8NCU8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LINC00116Q8NCU8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LINC00116Q8NCU8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LINC00116Q8NCU8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
LINC00116Q8NCU8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LINC00116Q8NCU8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LINC00116Q8NCU8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LINC00116Q8NCU8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LINC00116Q8NCU8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LINC00116Q8NCU8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
LINC00116Q8NCU8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
LINC00116Q8NCU8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
LINC00116Q8NCU8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
LINC00116Q8NCU8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LINC00116Q8NCU8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
LINC00116Q8NCU8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LINC00116Q8NCU8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LINC00116Q8NCU8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LINC00116Q8NCU8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LINC00116Q8NCU8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LINC00116Q8NCU8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LINC00116Q8NCU8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LINC00116Q8NCU8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LINC00116Q8NCU8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
LINC00116Q8NCU8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
LINC00116Q8NCU8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms