Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8D1

PDCD7, Programmed cell death protein 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD7Q8N8D1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDCD7Q8N8D1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDCD7Q8N8D1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDCD7Q8N8D1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDCD7Q8N8D1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDCD7Q8N8D1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PDCD7Q8N8D1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDCD7Q8N8D1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDCD7Q8N8D1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCD7Q8N8D1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCD7Q8N8D1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCD7Q8N8D1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCD7Q8N8D1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCD7Q8N8D1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCD7Q8N8D1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCD7Q8N8D1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCD7Q8N8D1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCD7Q8N8D1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDCD7Q8N8D1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDCD7Q8N8D1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PDCD7Q8N8D1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDCD7Q8N8D1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDCD7Q8N8D1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDCD7Q8N8D1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDCD7Q8N8D1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PDCD7Q8N8D1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDCD7Q8N8D1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PDCD7Q8N8D1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PDCD7Q8N8D1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDCD7Q8N8D1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDCD7Q8N8D1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDCD7Q8N8D1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDCD7Q8N8D1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDCD7Q8N8D1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDCD7Q8N8D1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDCD7Q8N8D1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDCD7Q8N8D1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDCD7Q8N8D1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDCD7Q8N8D1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDCD7Q8N8D1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDCD7Q8N8D1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDCD7Q8N8D1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDCD7Q8N8D1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDCD7Q8N8D1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PDCD7Q8N8D1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDCD7Q8N8D1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDCD7Q8N8D1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PDCD7Q8N8D1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PDCD7Q8N8D1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDCD7Q8N8D1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDCD7Q8N8D1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDCD7Q8N8D1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDCD7Q8N8D1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDCD7Q8N8D1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDCD7Q8N8D1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDCD7Q8N8D1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDCD7Q8N8D1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDCD7Q8N8D1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDCD7Q8N8D1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDCD7Q8N8D1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDCD7Q8N8D1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDCD7Q8N8D1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDCD7Q8N8D1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDCD7Q8N8D1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDCD7Q8N8D1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PDCD7Q8N8D1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDCD7Q8N8D1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDCD7Q8N8D1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDCD7Q8N8D1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PDCD7Q8N8D1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDCD7Q8N8D1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDCD7Q8N8D1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDCD7Q8N8D1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDCD7Q8N8D1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDCD7Q8N8D1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDCD7Q8N8D1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDCD7Q8N8D1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDCD7Q8N8D1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDCD7Q8N8D1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDCD7Q8N8D1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PDCD7Q8N8D1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDCD7Q8N8D1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PDCD7Q8N8D1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDCD7Q8N8D1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDCD7Q8N8D1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDCD7Q8N8D1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCD7Q8N8D1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCD7Q8N8D1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCD7Q8N8D1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCD7Q8N8D1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCD7Q8N8D1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCD7Q8N8D1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCD7Q8N8D1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDCD7Q8N8D1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PDCD7Q8N8D1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDCD7Q8N8D1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDCD7Q8N8D1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDCD7Q8N8D1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDCD7Q8N8D1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDCD7Q8N8D1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms