Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVT5

KSR1, Kinase suppressor of Ras 1, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KSR1Q8IVT5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KSR1Q8IVT5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KSR1Q8IVT5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KSR1Q8IVT5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KSR1Q8IVT5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KSR1Q8IVT5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KSR1Q8IVT5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KSR1Q8IVT5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KSR1Q8IVT5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KSR1Q8IVT5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
KSR1Q8IVT5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KSR1Q8IVT5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KSR1Q8IVT5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KSR1Q8IVT5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KSR1Q8IVT5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KSR1Q8IVT5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KSR1Q8IVT5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KSR1Q8IVT5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KSR1Q8IVT5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KSR1Q8IVT5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26■■□□□ 1.75
KSR1Q8IVT5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KSR1Q8IVT5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KSR1Q8IVT5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KSR1Q8IVT5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KSR1Q8IVT5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
KSR1Q8IVT5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KSR1Q8IVT5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KSR1Q8IVT5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KSR1Q8IVT5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KSR1Q8IVT5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KSR1Q8IVT5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KSR1Q8IVT5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KSR1Q8IVT5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KSR1Q8IVT5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KSR1Q8IVT5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KSR1Q8IVT5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
KSR1Q8IVT5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KSR1Q8IVT5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KSR1Q8IVT5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KSR1Q8IVT5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KSR1Q8IVT5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KSR1Q8IVT5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KSR1Q8IVT5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KSR1Q8IVT5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KSR1Q8IVT5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KSR1Q8IVT5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KSR1Q8IVT5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KSR1Q8IVT5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KSR1Q8IVT5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KSR1Q8IVT5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
KSR1Q8IVT5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
KSR1Q8IVT5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KSR1Q8IVT5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KSR1Q8IVT5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KSR1Q8IVT5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KSR1Q8IVT5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KSR1Q8IVT5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KSR1Q8IVT5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KSR1Q8IVT5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KSR1Q8IVT5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KSR1Q8IVT5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KSR1Q8IVT5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KSR1Q8IVT5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KSR1Q8IVT5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KSR1Q8IVT5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KSR1Q8IVT5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KSR1Q8IVT5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KSR1Q8IVT5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KSR1Q8IVT5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KSR1Q8IVT5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
KSR1Q8IVT5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
KSR1Q8IVT5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KSR1Q8IVT5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KSR1Q8IVT5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
KSR1Q8IVT5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KSR1Q8IVT5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KSR1Q8IVT5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
KSR1Q8IVT5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KSR1Q8IVT5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KSR1Q8IVT5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KSR1Q8IVT5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KSR1Q8IVT5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KSR1Q8IVT5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KSR1Q8IVT5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KSR1Q8IVT5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KSR1Q8IVT5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KSR1Q8IVT5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KSR1Q8IVT5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
KSR1Q8IVT5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KSR1Q8IVT5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KSR1Q8IVT5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KSR1Q8IVT5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KSR1Q8IVT5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KSR1Q8IVT5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KSR1Q8IVT5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KSR1Q8IVT5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KSR1Q8IVT5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KSR1Q8IVT5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KSR1Q8IVT5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KSR1Q8IVT5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms