Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF06

TRMT10B, tRNA methyltransferase 10 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT10BQ6PF06 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRMT10BQ6PF06 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRMT10BQ6PF06 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRMT10BQ6PF06 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRMT10BQ6PF06 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRMT10BQ6PF06 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRMT10BQ6PF06 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRMT10BQ6PF06 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRMT10BQ6PF06 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRMT10BQ6PF06 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRMT10BQ6PF06 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRMT10BQ6PF06 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRMT10BQ6PF06 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRMT10BQ6PF06 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRMT10BQ6PF06 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRMT10BQ6PF06 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRMT10BQ6PF06 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRMT10BQ6PF06 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRMT10BQ6PF06 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRMT10BQ6PF06 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRMT10BQ6PF06 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRMT10BQ6PF06 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRMT10BQ6PF06 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRMT10BQ6PF06 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRMT10BQ6PF06 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRMT10BQ6PF06 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRMT10BQ6PF06 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRMT10BQ6PF06 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRMT10BQ6PF06 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRMT10BQ6PF06 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRMT10BQ6PF06 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRMT10BQ6PF06 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRMT10BQ6PF06 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRMT10BQ6PF06 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRMT10BQ6PF06 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRMT10BQ6PF06 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRMT10BQ6PF06 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRMT10BQ6PF06 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRMT10BQ6PF06 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRMT10BQ6PF06 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRMT10BQ6PF06 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRMT10BQ6PF06 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRMT10BQ6PF06 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRMT10BQ6PF06 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRMT10BQ6PF06 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRMT10BQ6PF06 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRMT10BQ6PF06 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRMT10BQ6PF06 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRMT10BQ6PF06 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRMT10BQ6PF06 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRMT10BQ6PF06 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRMT10BQ6PF06 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRMT10BQ6PF06 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRMT10BQ6PF06 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRMT10BQ6PF06 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRMT10BQ6PF06 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRMT10BQ6PF06 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRMT10BQ6PF06 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRMT10BQ6PF06 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRMT10BQ6PF06 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRMT10BQ6PF06 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRMT10BQ6PF06 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRMT10BQ6PF06 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRMT10BQ6PF06 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRMT10BQ6PF06 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRMT10BQ6PF06 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRMT10BQ6PF06 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRMT10BQ6PF06 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRMT10BQ6PF06 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRMT10BQ6PF06 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRMT10BQ6PF06 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRMT10BQ6PF06 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRMT10BQ6PF06 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRMT10BQ6PF06 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRMT10BQ6PF06 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRMT10BQ6PF06 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRMT10BQ6PF06 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRMT10BQ6PF06 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRMT10BQ6PF06 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRMT10BQ6PF06 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRMT10BQ6PF06 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRMT10BQ6PF06 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRMT10BQ6PF06 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRMT10BQ6PF06 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRMT10BQ6PF06 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRMT10BQ6PF06 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRMT10BQ6PF06 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRMT10BQ6PF06 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRMT10BQ6PF06 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRMT10BQ6PF06 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRMT10BQ6PF06 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRMT10BQ6PF06 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRMT10BQ6PF06 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRMT10BQ6PF06 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRMT10BQ6PF06 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRMT10BQ6PF06 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRMT10BQ6PF06 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRMT10BQ6PF06 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRMT10BQ6PF06 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRMT10BQ6PF06 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms