Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR3

TYW3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYW3Q6IPR3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TYW3Q6IPR3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TYW3Q6IPR3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TYW3Q6IPR3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TYW3Q6IPR3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TYW3Q6IPR3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TYW3Q6IPR3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TYW3Q6IPR3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TYW3Q6IPR3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TYW3Q6IPR3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TYW3Q6IPR3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TYW3Q6IPR3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TYW3Q6IPR3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TYW3Q6IPR3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TYW3Q6IPR3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TYW3Q6IPR3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TYW3Q6IPR3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TYW3Q6IPR3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TYW3Q6IPR3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TYW3Q6IPR3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TYW3Q6IPR3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TYW3Q6IPR3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TYW3Q6IPR3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TYW3Q6IPR3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TYW3Q6IPR3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TYW3Q6IPR3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TYW3Q6IPR3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TYW3Q6IPR3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TYW3Q6IPR3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TYW3Q6IPR3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TYW3Q6IPR3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TYW3Q6IPR3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TYW3Q6IPR3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TYW3Q6IPR3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TYW3Q6IPR3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TYW3Q6IPR3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TYW3Q6IPR3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TYW3Q6IPR3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TYW3Q6IPR3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TYW3Q6IPR3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TYW3Q6IPR3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TYW3Q6IPR3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TYW3Q6IPR3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TYW3Q6IPR3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TYW3Q6IPR3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TYW3Q6IPR3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TYW3Q6IPR3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TYW3Q6IPR3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TYW3Q6IPR3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TYW3Q6IPR3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TYW3Q6IPR3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TYW3Q6IPR3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TYW3Q6IPR3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TYW3Q6IPR3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TYW3Q6IPR3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TYW3Q6IPR3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TYW3Q6IPR3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TYW3Q6IPR3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TYW3Q6IPR3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TYW3Q6IPR3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TYW3Q6IPR3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TYW3Q6IPR3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TYW3Q6IPR3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TYW3Q6IPR3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TYW3Q6IPR3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TYW3Q6IPR3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TYW3Q6IPR3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TYW3Q6IPR3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TYW3Q6IPR3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TYW3Q6IPR3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TYW3Q6IPR3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TYW3Q6IPR3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TYW3Q6IPR3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TYW3Q6IPR3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TYW3Q6IPR3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TYW3Q6IPR3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TYW3Q6IPR3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TYW3Q6IPR3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TYW3Q6IPR3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TYW3Q6IPR3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TYW3Q6IPR3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TYW3Q6IPR3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TYW3Q6IPR3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TYW3Q6IPR3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TYW3Q6IPR3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TYW3Q6IPR3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TYW3Q6IPR3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TYW3Q6IPR3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TYW3Q6IPR3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TYW3Q6IPR3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TYW3Q6IPR3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TYW3Q6IPR3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TYW3Q6IPR3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TYW3Q6IPR3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TYW3Q6IPR3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TYW3Q6IPR3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TYW3Q6IPR3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TYW3Q6IPR3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TYW3Q6IPR3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TYW3Q6IPR3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms