Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4D3

TMTC4, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMTC4Q5T4D3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMTC4Q5T4D3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMTC4Q5T4D3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMTC4Q5T4D3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMTC4Q5T4D3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMTC4Q5T4D3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMTC4Q5T4D3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMTC4Q5T4D3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMTC4Q5T4D3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMTC4Q5T4D3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMTC4Q5T4D3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMTC4Q5T4D3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMTC4Q5T4D3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMTC4Q5T4D3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMTC4Q5T4D3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMTC4Q5T4D3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMTC4Q5T4D3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMTC4Q5T4D3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMTC4Q5T4D3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMTC4Q5T4D3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMTC4Q5T4D3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMTC4Q5T4D3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TMTC4Q5T4D3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMTC4Q5T4D3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMTC4Q5T4D3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMTC4Q5T4D3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMTC4Q5T4D3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMTC4Q5T4D3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMTC4Q5T4D3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMTC4Q5T4D3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMTC4Q5T4D3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMTC4Q5T4D3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMTC4Q5T4D3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMTC4Q5T4D3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMTC4Q5T4D3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMTC4Q5T4D3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMTC4Q5T4D3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMTC4Q5T4D3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMTC4Q5T4D3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMTC4Q5T4D3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMTC4Q5T4D3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMTC4Q5T4D3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMTC4Q5T4D3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMTC4Q5T4D3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMTC4Q5T4D3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMTC4Q5T4D3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMTC4Q5T4D3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMTC4Q5T4D3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMTC4Q5T4D3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMTC4Q5T4D3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMTC4Q5T4D3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMTC4Q5T4D3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMTC4Q5T4D3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms