Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY52

ZIK1, Zinc finger protein interacting with ribonucleoprotein K, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIK1Q3SY52 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZIK1Q3SY52 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZIK1Q3SY52 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZIK1Q3SY52 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZIK1Q3SY52 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZIK1Q3SY52 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZIK1Q3SY52 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIK1Q3SY52 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIK1Q3SY52 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIK1Q3SY52 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIK1Q3SY52 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIK1Q3SY52 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIK1Q3SY52 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZIK1Q3SY52 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZIK1Q3SY52 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZIK1Q3SY52 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZIK1Q3SY52 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZIK1Q3SY52 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZIK1Q3SY52 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZIK1Q3SY52 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ZIK1Q3SY52 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZIK1Q3SY52 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZIK1Q3SY52 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZIK1Q3SY52 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZIK1Q3SY52 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZIK1Q3SY52 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZIK1Q3SY52 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZIK1Q3SY52 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZIK1Q3SY52 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZIK1Q3SY52 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZIK1Q3SY52 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZIK1Q3SY52 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZIK1Q3SY52 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZIK1Q3SY52 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZIK1Q3SY52 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZIK1Q3SY52 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZIK1Q3SY52 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ZIK1Q3SY52 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZIK1Q3SY52 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZIK1Q3SY52 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZIK1Q3SY52 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZIK1Q3SY52 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZIK1Q3SY52 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZIK1Q3SY52 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZIK1Q3SY52 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZIK1Q3SY52 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZIK1Q3SY52 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZIK1Q3SY52 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZIK1Q3SY52 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZIK1Q3SY52 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZIK1Q3SY52 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZIK1Q3SY52 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZIK1Q3SY52 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZIK1Q3SY52 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZIK1Q3SY52 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZIK1Q3SY52 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZIK1Q3SY52 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ZIK1Q3SY52 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZIK1Q3SY52 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ZIK1Q3SY52 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZIK1Q3SY52 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZIK1Q3SY52 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZIK1Q3SY52 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZIK1Q3SY52 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZIK1Q3SY52 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZIK1Q3SY52 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZIK1Q3SY52 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZIK1Q3SY52 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZIK1Q3SY52 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZIK1Q3SY52 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ZIK1Q3SY52 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZIK1Q3SY52 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZIK1Q3SY52 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZIK1Q3SY52 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZIK1Q3SY52 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZIK1Q3SY52 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZIK1Q3SY52 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ZIK1Q3SY52 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ZIK1Q3SY52 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZIK1Q3SY52 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZIK1Q3SY52 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZIK1Q3SY52 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZIK1Q3SY52 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZIK1Q3SY52 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZIK1Q3SY52 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ZIK1Q3SY52 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZIK1Q3SY52 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZIK1Q3SY52 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZIK1Q3SY52 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZIK1Q3SY52 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZIK1Q3SY52 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZIK1Q3SY52 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZIK1Q3SY52 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIK1Q3SY52 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIK1Q3SY52 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIK1Q3SY52 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIK1Q3SY52 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIK1Q3SY52 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIK1Q3SY52 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIK1Q3SY52 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms