Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PROX2Q3B8N5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PROX2Q3B8N5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PROX2Q3B8N5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PROX2Q3B8N5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PROX2Q3B8N5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PROX2Q3B8N5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PROX2Q3B8N5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PROX2Q3B8N5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PROX2Q3B8N5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PROX2Q3B8N5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PROX2Q3B8N5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PROX2Q3B8N5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PROX2Q3B8N5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PROX2Q3B8N5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PROX2Q3B8N5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PROX2Q3B8N5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PROX2Q3B8N5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PROX2Q3B8N5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PROX2Q3B8N5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PROX2Q3B8N5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PROX2Q3B8N5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PROX2Q3B8N5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PROX2Q3B8N5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PROX2Q3B8N5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PROX2Q3B8N5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PROX2Q3B8N5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PROX2Q3B8N5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PROX2Q3B8N5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PROX2Q3B8N5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PROX2Q3B8N5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PROX2Q3B8N5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PROX2Q3B8N5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PROX2Q3B8N5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PROX2Q3B8N5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PROX2Q3B8N5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PROX2Q3B8N5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PROX2Q3B8N5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PROX2Q3B8N5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PROX2Q3B8N5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PROX2Q3B8N5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PROX2Q3B8N5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PROX2Q3B8N5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PROX2Q3B8N5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PROX2Q3B8N5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PROX2Q3B8N5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PROX2Q3B8N5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PROX2Q3B8N5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PROX2Q3B8N5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PROX2Q3B8N5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PROX2Q3B8N5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PROX2Q3B8N5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PROX2Q3B8N5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PROX2Q3B8N5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PROX2Q3B8N5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PROX2Q3B8N5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PROX2Q3B8N5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PROX2Q3B8N5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PROX2Q3B8N5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PROX2Q3B8N5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PROX2Q3B8N5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PROX2Q3B8N5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PROX2Q3B8N5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PROX2Q3B8N5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PROX2Q3B8N5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PROX2Q3B8N5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PROX2Q3B8N5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PROX2Q3B8N5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PROX2Q3B8N5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PROX2Q3B8N5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PROX2Q3B8N5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PROX2Q3B8N5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PROX2Q3B8N5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PROX2Q3B8N5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PROX2Q3B8N5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PROX2Q3B8N5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PROX2Q3B8N5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PROX2Q3B8N5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PROX2Q3B8N5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PROX2Q3B8N5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PROX2Q3B8N5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PROX2Q3B8N5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PROX2Q3B8N5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PROX2Q3B8N5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PROX2Q3B8N5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PROX2Q3B8N5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PROX2Q3B8N5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PROX2Q3B8N5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PROX2Q3B8N5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PROX2Q3B8N5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PROX2Q3B8N5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PROX2Q3B8N5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PROX2Q3B8N5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PROX2Q3B8N5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PROX2Q3B8N5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PROX2Q3B8N5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PROX2Q3B8N5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PROX2Q3B8N5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PROX2Q3B8N5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PROX2Q3B8N5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.3 ms