Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CA9Q16790 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CA9Q16790 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CA9Q16790 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CA9Q16790 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CA9Q16790 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CA9Q16790 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CA9Q16790 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CA9Q16790 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CA9Q16790 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CA9Q16790 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CA9Q16790 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CA9Q16790 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CA9Q16790 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CA9Q16790 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CA9Q16790 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CA9Q16790 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CA9Q16790 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CA9Q16790 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CA9Q16790 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CA9Q16790 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CA9Q16790 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CA9Q16790 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CA9Q16790 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CA9Q16790 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CA9Q16790 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CA9Q16790 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CA9Q16790 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CA9Q16790 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CA9Q16790 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CA9Q16790 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CA9Q16790 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CA9Q16790 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CA9Q16790 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CA9Q16790 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CA9Q16790 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CA9Q16790 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CA9Q16790 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CA9Q16790 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CA9Q16790 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CA9Q16790 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CA9Q16790 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CA9Q16790 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CA9Q16790 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CA9Q16790 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CA9Q16790 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CA9Q16790 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CA9Q16790 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CA9Q16790 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CA9Q16790 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CA9Q16790 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CA9Q16790 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CA9Q16790 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CA9Q16790 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CA9Q16790 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CA9Q16790 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CA9Q16790 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CA9Q16790 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CA9Q16790 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CA9Q16790 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CA9Q16790 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CA9Q16790 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CA9Q16790 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CA9Q16790 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CA9Q16790 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CA9Q16790 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CA9Q16790 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CA9Q16790 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CA9Q16790 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CA9Q16790 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CA9Q16790 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CA9Q16790 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CA9Q16790 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CA9Q16790 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CA9Q16790 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CA9Q16790 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CA9Q16790 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CA9Q16790 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CA9Q16790 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CA9Q16790 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CA9Q16790 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CA9Q16790 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CA9Q16790 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CA9Q16790 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CA9Q16790 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CA9Q16790 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CA9Q16790 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CA9Q16790 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CA9Q16790 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CA9Q16790 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CA9Q16790 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CA9Q16790 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CA9Q16790 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CA9Q16790 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CA9Q16790 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CA9Q16790 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CA9Q16790 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CA9Q16790 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CA9Q16790 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CA9Q16790 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms