Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTF1Q16619 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTF1Q16619 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTF1Q16619 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTF1Q16619 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTF1Q16619 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTF1Q16619 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTF1Q16619 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTF1Q16619 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTF1Q16619 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTF1Q16619 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTF1Q16619 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTF1Q16619 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTF1Q16619 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTF1Q16619 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTF1Q16619 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTF1Q16619 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTF1Q16619 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTF1Q16619 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTF1Q16619 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTF1Q16619 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTF1Q16619 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTF1Q16619 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTF1Q16619 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTF1Q16619 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTF1Q16619 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTF1Q16619 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTF1Q16619 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTF1Q16619 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTF1Q16619 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTF1Q16619 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTF1Q16619 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTF1Q16619 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CTF1Q16619 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTF1Q16619 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTF1Q16619 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTF1Q16619 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTF1Q16619 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTF1Q16619 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTF1Q16619 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTF1Q16619 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CTF1Q16619 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTF1Q16619 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CTF1Q16619 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CTF1Q16619 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTF1Q16619 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTF1Q16619 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTF1Q16619 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTF1Q16619 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTF1Q16619 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTF1Q16619 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTF1Q16619 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTF1Q16619 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTF1Q16619 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTF1Q16619 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTF1Q16619 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTF1Q16619 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTF1Q16619 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTF1Q16619 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTF1Q16619 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTF1Q16619 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTF1Q16619 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CTF1Q16619 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTF1Q16619 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTF1Q16619 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTF1Q16619 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTF1Q16619 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTF1Q16619 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTF1Q16619 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTF1Q16619 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTF1Q16619 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTF1Q16619 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTF1Q16619 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTF1Q16619 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTF1Q16619 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTF1Q16619 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTF1Q16619 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTF1Q16619 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTF1Q16619 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTF1Q16619 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTF1Q16619 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTF1Q16619 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTF1Q16619 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTF1Q16619 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTF1Q16619 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CTF1Q16619 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTF1Q16619 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTF1Q16619 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTF1Q16619 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTF1Q16619 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTF1Q16619 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTF1Q16619 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTF1Q16619 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTF1Q16619 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTF1Q16619 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTF1Q16619 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTF1Q16619 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTF1Q16619 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTF1Q16619 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTF1Q16619 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms