Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRCAPQ14761 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRCAPQ14761 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRCAPQ14761 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRCAPQ14761 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRCAPQ14761 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRCAPQ14761 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRCAPQ14761 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRCAPQ14761 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRCAPQ14761 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRCAPQ14761 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRCAPQ14761 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRCAPQ14761 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRCAPQ14761 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRCAPQ14761 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRCAPQ14761 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRCAPQ14761 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRCAPQ14761 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRCAPQ14761 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRCAPQ14761 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRCAPQ14761 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRCAPQ14761 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRCAPQ14761 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRCAPQ14761 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRCAPQ14761 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRCAPQ14761 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRCAPQ14761 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRCAPQ14761 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRCAPQ14761 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRCAPQ14761 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRCAPQ14761 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRCAPQ14761 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRCAPQ14761 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRCAPQ14761 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRCAPQ14761 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRCAPQ14761 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRCAPQ14761 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRCAPQ14761 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRCAPQ14761 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRCAPQ14761 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRCAPQ14761 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRCAPQ14761 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRCAPQ14761 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRCAPQ14761 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRCAPQ14761 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRCAPQ14761 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRCAPQ14761 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRCAPQ14761 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRCAPQ14761 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRCAPQ14761 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRCAPQ14761 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRCAPQ14761 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRCAPQ14761 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRCAPQ14761 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRCAPQ14761 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRCAPQ14761 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRCAPQ14761 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRCAPQ14761 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRCAPQ14761 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRCAPQ14761 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRCAPQ14761 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRCAPQ14761 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRCAPQ14761 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRCAPQ14761 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRCAPQ14761 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRCAPQ14761 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRCAPQ14761 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRCAPQ14761 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRCAPQ14761 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRCAPQ14761 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRCAPQ14761 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRCAPQ14761 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRCAPQ14761 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRCAPQ14761 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRCAPQ14761 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRCAPQ14761 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRCAPQ14761 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRCAPQ14761 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRCAPQ14761 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRCAPQ14761 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRCAPQ14761 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRCAPQ14761 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRCAPQ14761 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRCAPQ14761 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRCAPQ14761 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRCAPQ14761 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRCAPQ14761 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRCAPQ14761 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRCAPQ14761 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRCAPQ14761 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRCAPQ14761 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRCAPQ14761 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRCAPQ14761 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRCAPQ14761 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRCAPQ14761 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRCAPQ14761 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRCAPQ14761 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRCAPQ14761 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRCAPQ14761 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRCAPQ14761 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
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