Protein–RNA interactions for Protein: Q13200

PSMD2, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD2Q13200 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSMD2Q13200 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSMD2Q13200 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSMD2Q13200 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSMD2Q13200 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSMD2Q13200 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PSMD2Q13200 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSMD2Q13200 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSMD2Q13200 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSMD2Q13200 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSMD2Q13200 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSMD2Q13200 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSMD2Q13200 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSMD2Q13200 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PSMD2Q13200 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PSMD2Q13200 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMD2Q13200 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMD2Q13200 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMD2Q13200 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMD2Q13200 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMD2Q13200 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMD2Q13200 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMD2Q13200 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMD2Q13200 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMD2Q13200 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMD2Q13200 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMD2Q13200 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMD2Q13200 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMD2Q13200 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMD2Q13200 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMD2Q13200 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSMD2Q13200 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSMD2Q13200 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSMD2Q13200 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSMD2Q13200 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSMD2Q13200 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSMD2Q13200 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSMD2Q13200 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMD2Q13200 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMD2Q13200 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMD2Q13200 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMD2Q13200 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMD2Q13200 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMD2Q13200 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMD2Q13200 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMD2Q13200 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMD2Q13200 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMD2Q13200 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMD2Q13200 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMD2Q13200 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMD2Q13200 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMD2Q13200 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMD2Q13200 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMD2Q13200 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMD2Q13200 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMD2Q13200 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMD2Q13200 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMD2Q13200 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMD2Q13200 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMD2Q13200 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMD2Q13200 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PSMD2Q13200 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PSMD2Q13200 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMD2Q13200 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMD2Q13200 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMD2Q13200 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMD2Q13200 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMD2Q13200 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMD2Q13200 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMD2Q13200 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMD2Q13200 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSMD2Q13200 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSMD2Q13200 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSMD2Q13200 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSMD2Q13200 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSMD2Q13200 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSMD2Q13200 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSMD2Q13200 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSMD2Q13200 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSMD2Q13200 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMD2Q13200 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMD2Q13200 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMD2Q13200 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMD2Q13200 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMD2Q13200 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMD2Q13200 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMD2Q13200 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMD2Q13200 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSMD2Q13200 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSMD2Q13200 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSMD2Q13200 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSMD2Q13200 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PSMD2Q13200 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSMD2Q13200 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSMD2Q13200 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSMD2Q13200 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSMD2Q13200 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSMD2Q13200 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSMD2Q13200 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSMD2Q13200 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms