Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
MKRN3Q13064 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MKRN3Q13064 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
MKRN3Q13064 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MKRN3Q13064 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MKRN3Q13064 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MKRN3Q13064 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MKRN3Q13064 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MKRN3Q13064 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
MKRN3Q13064 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MKRN3Q13064 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MKRN3Q13064 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MKRN3Q13064 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MKRN3Q13064 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MKRN3Q13064 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
MKRN3Q13064 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MKRN3Q13064 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MKRN3Q13064 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MKRN3Q13064 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MKRN3Q13064 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MKRN3Q13064 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MKRN3Q13064 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MKRN3Q13064 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MKRN3Q13064 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MKRN3Q13064 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MKRN3Q13064 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MKRN3Q13064 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MKRN3Q13064 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MKRN3Q13064 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MKRN3Q13064 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MKRN3Q13064 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MKRN3Q13064 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MKRN3Q13064 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MKRN3Q13064 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MKRN3Q13064 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MKRN3Q13064 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MKRN3Q13064 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MKRN3Q13064 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MKRN3Q13064 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MKRN3Q13064 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MKRN3Q13064 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MKRN3Q13064 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MKRN3Q13064 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MKRN3Q13064 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MKRN3Q13064 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MKRN3Q13064 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MKRN3Q13064 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MKRN3Q13064 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MKRN3Q13064 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MKRN3Q13064 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MKRN3Q13064 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
MKRN3Q13064 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MKRN3Q13064 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
MKRN3Q13064 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MKRN3Q13064 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MKRN3Q13064 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MKRN3Q13064 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MKRN3Q13064 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MKRN3Q13064 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MKRN3Q13064 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MKRN3Q13064 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MKRN3Q13064 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MKRN3Q13064 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MKRN3Q13064 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MKRN3Q13064 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
MKRN3Q13064 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MKRN3Q13064 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MKRN3Q13064 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
MKRN3Q13064 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MKRN3Q13064 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MKRN3Q13064 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MKRN3Q13064 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MKRN3Q13064 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MKRN3Q13064 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MKRN3Q13064 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
MKRN3Q13064 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MKRN3Q13064 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MKRN3Q13064 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MKRN3Q13064 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MKRN3Q13064 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MKRN3Q13064 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
MKRN3Q13064 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MKRN3Q13064 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MKRN3Q13064 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MKRN3Q13064 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MKRN3Q13064 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MKRN3Q13064 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MKRN3Q13064 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MKRN3Q13064 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MKRN3Q13064 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MKRN3Q13064 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MKRN3Q13064 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MKRN3Q13064 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
MKRN3Q13064 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MKRN3Q13064 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MKRN3Q13064 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MKRN3Q13064 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MKRN3Q13064 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
MKRN3Q13064 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MKRN3Q13064 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms