Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NPRL3Q12980 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPRL3Q12980 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPRL3Q12980 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPRL3Q12980 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPRL3Q12980 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPRL3Q12980 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPRL3Q12980 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPRL3Q12980 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPRL3Q12980 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPRL3Q12980 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPRL3Q12980 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPRL3Q12980 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPRL3Q12980 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPRL3Q12980 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPRL3Q12980 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPRL3Q12980 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPRL3Q12980 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPRL3Q12980 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NPRL3Q12980 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPRL3Q12980 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPRL3Q12980 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPRL3Q12980 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NPRL3Q12980 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPRL3Q12980 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPRL3Q12980 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NPRL3Q12980 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NPRL3Q12980 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPRL3Q12980 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPRL3Q12980 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPRL3Q12980 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPRL3Q12980 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NPRL3Q12980 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NPRL3Q12980 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPRL3Q12980 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPRL3Q12980 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPRL3Q12980 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPRL3Q12980 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPRL3Q12980 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPRL3Q12980 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPRL3Q12980 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPRL3Q12980 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPRL3Q12980 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPRL3Q12980 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPRL3Q12980 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPRL3Q12980 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPRL3Q12980 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPRL3Q12980 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPRL3Q12980 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPRL3Q12980 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPRL3Q12980 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPRL3Q12980 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPRL3Q12980 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPRL3Q12980 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPRL3Q12980 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPRL3Q12980 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPRL3Q12980 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPRL3Q12980 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPRL3Q12980 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPRL3Q12980 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPRL3Q12980 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPRL3Q12980 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPRL3Q12980 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NPRL3Q12980 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPRL3Q12980 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPRL3Q12980 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPRL3Q12980 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPRL3Q12980 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPRL3Q12980 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPRL3Q12980 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NPRL3Q12980 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
NPRL3Q12980 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NPRL3Q12980 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPRL3Q12980 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPRL3Q12980 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPRL3Q12980 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPRL3Q12980 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPRL3Q12980 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPRL3Q12980 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPRL3Q12980 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPRL3Q12980 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPRL3Q12980 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPRL3Q12980 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPRL3Q12980 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPRL3Q12980 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPRL3Q12980 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NPRL3Q12980 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPRL3Q12980 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPRL3Q12980 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPRL3Q12980 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPRL3Q12980 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPRL3Q12980 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPRL3Q12980 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPRL3Q12980 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPRL3Q12980 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPRL3Q12980 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPRL3Q12980 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPRL3Q12980 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPRL3Q12980 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPRL3Q12980 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms