Protein–RNA interactions for Protein: Q06141

REG3A, Regenerating islet-derived protein 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG3AQ06141 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
REG3AQ06141 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms