Protein–RNA interactions for Protein: P62851

RPS25, 40S ribosomal protein S25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS25P62851 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPS25P62851 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPS25P62851 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
RPS25P62851 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPS25P62851 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPS25P62851 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPS25P62851 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPS25P62851 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RPS25P62851 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
RPS25P62851 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RPS25P62851 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RPS25P62851 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RPS25P62851 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPS25P62851 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPS25P62851 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPS25P62851 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPS25P62851 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPS25P62851 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPS25P62851 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPS25P62851 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPS25P62851 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPS25P62851 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPS25P62851 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPS25P62851 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPS25P62851 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPS25P62851 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPS25P62851 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPS25P62851 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPS25P62851 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPS25P62851 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPS25P62851 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPS25P62851 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPS25P62851 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPS25P62851 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPS25P62851 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPS25P62851 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPS25P62851 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPS25P62851 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPS25P62851 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPS25P62851 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPS25P62851 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPS25P62851 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPS25P62851 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPS25P62851 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPS25P62851 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPS25P62851 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPS25P62851 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPS25P62851 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPS25P62851 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPS25P62851 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPS25P62851 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPS25P62851 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPS25P62851 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPS25P62851 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPS25P62851 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPS25P62851 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPS25P62851 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPS25P62851 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPS25P62851 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPS25P62851 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPS25P62851 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPS25P62851 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPS25P62851 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPS25P62851 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPS25P62851 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPS25P62851 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPS25P62851 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPS25P62851 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPS25P62851 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPS25P62851 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPS25P62851 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPS25P62851 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPS25P62851 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPS25P62851 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPS25P62851 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPS25P62851 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPS25P62851 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPS25P62851 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPS25P62851 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPS25P62851 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPS25P62851 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPS25P62851 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RPS25P62851 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RPS25P62851 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPS25P62851 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPS25P62851 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPS25P62851 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPS25P62851 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPS25P62851 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPS25P62851 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPS25P62851 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPS25P62851 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPS25P62851 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPS25P62851 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPS25P62851 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPS25P62851 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPS25P62851 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPS25P62851 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPS25P62851 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPS25P62851 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms