Protein–RNA interactions for Protein: P53985

SLC16A1, Monocarboxylate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC16A1P53985 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC16A1P53985 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC16A1P53985 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SLC16A1P53985 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC16A1P53985 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC16A1P53985 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC16A1P53985 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC16A1P53985 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC16A1P53985 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC16A1P53985 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC16A1P53985 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC16A1P53985 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC16A1P53985 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC16A1P53985 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC16A1P53985 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC16A1P53985 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC16A1P53985 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC16A1P53985 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC16A1P53985 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC16A1P53985 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC16A1P53985 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC16A1P53985 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC16A1P53985 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC16A1P53985 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC16A1P53985 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC16A1P53985 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC16A1P53985 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC16A1P53985 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC16A1P53985 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC16A1P53985 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC16A1P53985 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC16A1P53985 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC16A1P53985 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC16A1P53985 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC16A1P53985 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC16A1P53985 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC16A1P53985 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC16A1P53985 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC16A1P53985 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC16A1P53985 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC16A1P53985 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC16A1P53985 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC16A1P53985 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC16A1P53985 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC16A1P53985 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC16A1P53985 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC16A1P53985 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC16A1P53985 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC16A1P53985 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC16A1P53985 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC16A1P53985 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC16A1P53985 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC16A1P53985 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC16A1P53985 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC16A1P53985 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC16A1P53985 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC16A1P53985 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC16A1P53985 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC16A1P53985 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC16A1P53985 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC16A1P53985 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC16A1P53985 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC16A1P53985 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC16A1P53985 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC16A1P53985 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC16A1P53985 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC16A1P53985 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC16A1P53985 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC16A1P53985 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC16A1P53985 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC16A1P53985 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLC16A1P53985 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC16A1P53985 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC16A1P53985 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC16A1P53985 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC16A1P53985 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC16A1P53985 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC16A1P53985 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC16A1P53985 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC16A1P53985 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC16A1P53985 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC16A1P53985 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC16A1P53985 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.5 ms