Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTDSS1P48651 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTDSS1P48651 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTDSS1P48651 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTDSS1P48651 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTDSS1P48651 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTDSS1P48651 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTDSS1P48651 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTDSS1P48651 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTDSS1P48651 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTDSS1P48651 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTDSS1P48651 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTDSS1P48651 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTDSS1P48651 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTDSS1P48651 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTDSS1P48651 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTDSS1P48651 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTDSS1P48651 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTDSS1P48651 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTDSS1P48651 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTDSS1P48651 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTDSS1P48651 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTDSS1P48651 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTDSS1P48651 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTDSS1P48651 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTDSS1P48651 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTDSS1P48651 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTDSS1P48651 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTDSS1P48651 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTDSS1P48651 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTDSS1P48651 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTDSS1P48651 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTDSS1P48651 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTDSS1P48651 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTDSS1P48651 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTDSS1P48651 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTDSS1P48651 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTDSS1P48651 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTDSS1P48651 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTDSS1P48651 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTDSS1P48651 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTDSS1P48651 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTDSS1P48651 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTDSS1P48651 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTDSS1P48651 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTDSS1P48651 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTDSS1P48651 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTDSS1P48651 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTDSS1P48651 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTDSS1P48651 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTDSS1P48651 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTDSS1P48651 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTDSS1P48651 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTDSS1P48651 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTDSS1P48651 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTDSS1P48651 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PTDSS1P48651 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PTDSS1P48651 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PTDSS1P48651 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTDSS1P48651 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PTDSS1P48651 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTDSS1P48651 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTDSS1P48651 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTDSS1P48651 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTDSS1P48651 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTDSS1P48651 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTDSS1P48651 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTDSS1P48651 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PTDSS1P48651 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTDSS1P48651 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTDSS1P48651 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTDSS1P48651 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTDSS1P48651 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTDSS1P48651 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTDSS1P48651 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTDSS1P48651 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTDSS1P48651 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTDSS1P48651 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTDSS1P48651 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTDSS1P48651 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTDSS1P48651 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTDSS1P48651 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTDSS1P48651 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTDSS1P48651 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTDSS1P48651 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTDSS1P48651 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTDSS1P48651 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTDSS1P48651 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTDSS1P48651 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTDSS1P48651 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTDSS1P48651 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTDSS1P48651 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTDSS1P48651 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTDSS1P48651 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTDSS1P48651 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTDSS1P48651 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTDSS1P48651 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTDSS1P48651 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTDSS1P48651 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTDSS1P48651 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms