Protein–RNA interactions for Protein: P40337

VHL, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VHLP40337 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VHLP40337 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VHLP40337 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VHLP40337 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VHLP40337 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VHLP40337 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VHLP40337 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VHLP40337 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VHLP40337 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VHLP40337 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VHLP40337 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VHLP40337 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VHLP40337 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VHLP40337 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
VHLP40337 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
VHLP40337 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VHLP40337 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VHLP40337 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VHLP40337 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VHLP40337 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VHLP40337 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
VHLP40337 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VHLP40337 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VHLP40337 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VHLP40337 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VHLP40337 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VHLP40337 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VHLP40337 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VHLP40337 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VHLP40337 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VHLP40337 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VHLP40337 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VHLP40337 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VHLP40337 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VHLP40337 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VHLP40337 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VHLP40337 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VHLP40337 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VHLP40337 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VHLP40337 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VHLP40337 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VHLP40337 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VHLP40337 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VHLP40337 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VHLP40337 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VHLP40337 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VHLP40337 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VHLP40337 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VHLP40337 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VHLP40337 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VHLP40337 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VHLP40337 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VHLP40337 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VHLP40337 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VHLP40337 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VHLP40337 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VHLP40337 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VHLP40337 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VHLP40337 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VHLP40337 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VHLP40337 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VHLP40337 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VHLP40337 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VHLP40337 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VHLP40337 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VHLP40337 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VHLP40337 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VHLP40337 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VHLP40337 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VHLP40337 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VHLP40337 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VHLP40337 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VHLP40337 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VHLP40337 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VHLP40337 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VHLP40337 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VHLP40337 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VHLP40337 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VHLP40337 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VHLP40337 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VHLP40337 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VHLP40337 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VHLP40337 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VHLP40337 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VHLP40337 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VHLP40337 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VHLP40337 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VHLP40337 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VHLP40337 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VHLP40337 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VHLP40337 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VHLP40337 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VHLP40337 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VHLP40337 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VHLP40337 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VHLP40337 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VHLP40337 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VHLP40337 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VHLP40337 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VHLP40337 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.9 ms