Protein–RNA interactions for Protein: P30041

PRDX6, Peroxiredoxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDX6P30041 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDX6P30041 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDX6P30041 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDX6P30041 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDX6P30041 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDX6P30041 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDX6P30041 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDX6P30041 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDX6P30041 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDX6P30041 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDX6P30041 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDX6P30041 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDX6P30041 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDX6P30041 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDX6P30041 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDX6P30041 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDX6P30041 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDX6P30041 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDX6P30041 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDX6P30041 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDX6P30041 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDX6P30041 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDX6P30041 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDX6P30041 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDX6P30041 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDX6P30041 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDX6P30041 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDX6P30041 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDX6P30041 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDX6P30041 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDX6P30041 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDX6P30041 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDX6P30041 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDX6P30041 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDX6P30041 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDX6P30041 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDX6P30041 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDX6P30041 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDX6P30041 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDX6P30041 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDX6P30041 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDX6P30041 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDX6P30041 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDX6P30041 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRDX6P30041 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRDX6P30041 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRDX6P30041 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRDX6P30041 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRDX6P30041 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRDX6P30041 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRDX6P30041 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRDX6P30041 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PRDX6P30041 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRDX6P30041 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDX6P30041 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDX6P30041 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDX6P30041 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDX6P30041 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDX6P30041 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDX6P30041 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDX6P30041 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDX6P30041 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDX6P30041 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDX6P30041 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDX6P30041 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDX6P30041 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDX6P30041 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDX6P30041 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDX6P30041 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDX6P30041 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDX6P30041 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDX6P30041 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDX6P30041 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDX6P30041 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDX6P30041 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDX6P30041 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDX6P30041 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDX6P30041 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDX6P30041 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDX6P30041 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDX6P30041 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDX6P30041 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDX6P30041 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDX6P30041 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDX6P30041 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDX6P30041 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDX6P30041 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDX6P30041 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDX6P30041 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDX6P30041 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDX6P30041 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDX6P30041 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDX6P30041 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDX6P30041 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDX6P30041 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDX6P30041 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDX6P30041 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDX6P30041 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDX6P30041 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDX6P30041 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.2 ms