Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXD10P28358 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXD10P28358 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXD10P28358 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXD10P28358 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXD10P28358 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXD10P28358 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXD10P28358 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXD10P28358 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXD10P28358 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXD10P28358 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXD10P28358 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXD10P28358 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXD10P28358 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXD10P28358 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXD10P28358 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXD10P28358 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXD10P28358 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXD10P28358 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXD10P28358 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXD10P28358 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXD10P28358 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXD10P28358 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXD10P28358 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXD10P28358 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXD10P28358 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXD10P28358 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXD10P28358 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXD10P28358 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXD10P28358 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXD10P28358 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXD10P28358 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXD10P28358 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXD10P28358 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXD10P28358 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXD10P28358 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXD10P28358 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXD10P28358 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXD10P28358 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXD10P28358 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXD10P28358 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXD10P28358 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXD10P28358 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXD10P28358 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXD10P28358 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXD10P28358 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXD10P28358 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXD10P28358 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXD10P28358 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXD10P28358 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXD10P28358 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXD10P28358 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXD10P28358 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXD10P28358 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXD10P28358 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXD10P28358 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXD10P28358 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXD10P28358 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXD10P28358 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXD10P28358 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXD10P28358 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXD10P28358 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXD10P28358 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXD10P28358 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXD10P28358 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXD10P28358 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXD10P28358 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXD10P28358 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXD10P28358 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXD10P28358 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXD10P28358 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXD10P28358 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXD10P28358 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXD10P28358 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXD10P28358 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXD10P28358 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXD10P28358 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXD10P28358 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXD10P28358 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXD10P28358 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXD10P28358 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXD10P28358 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXD10P28358 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXD10P28358 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXD10P28358 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXD10P28358 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXD10P28358 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXD10P28358 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXD10P28358 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXD10P28358 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXD10P28358 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXD10P28358 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXD10P28358 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXD10P28358 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXD10P28358 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXD10P28358 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXD10P28358 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXD10P28358 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXD10P28358 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXD10P28358 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms