Protein–RNA interactions for Protein: P21439

ABCB4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB4P21439 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCB4P21439 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCB4P21439 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCB4P21439 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCB4P21439 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCB4P21439 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCB4P21439 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCB4P21439 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCB4P21439 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCB4P21439 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCB4P21439 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCB4P21439 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCB4P21439 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCB4P21439 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCB4P21439 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCB4P21439 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCB4P21439 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCB4P21439 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCB4P21439 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCB4P21439 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCB4P21439 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCB4P21439 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCB4P21439 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCB4P21439 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCB4P21439 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCB4P21439 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCB4P21439 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCB4P21439 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCB4P21439 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCB4P21439 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCB4P21439 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCB4P21439 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCB4P21439 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCB4P21439 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCB4P21439 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCB4P21439 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCB4P21439 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCB4P21439 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCB4P21439 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCB4P21439 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCB4P21439 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCB4P21439 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCB4P21439 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCB4P21439 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCB4P21439 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCB4P21439 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCB4P21439 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCB4P21439 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCB4P21439 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCB4P21439 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ABCB4P21439 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ABCB4P21439 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCB4P21439 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCB4P21439 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCB4P21439 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCB4P21439 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCB4P21439 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCB4P21439 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCB4P21439 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCB4P21439 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCB4P21439 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCB4P21439 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCB4P21439 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCB4P21439 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCB4P21439 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCB4P21439 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCB4P21439 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCB4P21439 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCB4P21439 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCB4P21439 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCB4P21439 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCB4P21439 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCB4P21439 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCB4P21439 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCB4P21439 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCB4P21439 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCB4P21439 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCB4P21439 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCB4P21439 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCB4P21439 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCB4P21439 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCB4P21439 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCB4P21439 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCB4P21439 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCB4P21439 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCB4P21439 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCB4P21439 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCB4P21439 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCB4P21439 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCB4P21439 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCB4P21439 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCB4P21439 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCB4P21439 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCB4P21439 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCB4P21439 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCB4P21439 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCB4P21439 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCB4P21439 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCB4P21439 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCB4P21439 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.5 ms