Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT10P13645 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT10P13645 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT10P13645 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT10P13645 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT10P13645 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT10P13645 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT10P13645 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT10P13645 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT10P13645 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT10P13645 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT10P13645 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT10P13645 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT10P13645 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT10P13645 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT10P13645 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT10P13645 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT10P13645 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT10P13645 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT10P13645 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT10P13645 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT10P13645 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT10P13645 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT10P13645 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT10P13645 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT10P13645 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT10P13645 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT10P13645 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT10P13645 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT10P13645 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT10P13645 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT10P13645 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT10P13645 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT10P13645 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT10P13645 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT10P13645 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT10P13645 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT10P13645 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT10P13645 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT10P13645 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT10P13645 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT10P13645 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT10P13645 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT10P13645 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT10P13645 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT10P13645 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT10P13645 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT10P13645 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT10P13645 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT10P13645 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT10P13645 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT10P13645 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT10P13645 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT10P13645 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT10P13645 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT10P13645 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT10P13645 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT10P13645 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT10P13645 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT10P13645 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT10P13645 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT10P13645 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT10P13645 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT10P13645 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT10P13645 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT10P13645 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT10P13645 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT10P13645 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT10P13645 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT10P13645 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT10P13645 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT10P13645 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT10P13645 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT10P13645 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT10P13645 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT10P13645 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT10P13645 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT10P13645 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT10P13645 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT10P13645 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT10P13645 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT10P13645 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT10P13645 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT10P13645 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT10P13645 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT10P13645 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT10P13645 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT10P13645 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT10P13645 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT10P13645 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT10P13645 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT10P13645 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT10P13645 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT10P13645 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT10P13645 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT10P13645 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT10P13645 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT10P13645 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT10P13645 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT10P13645 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms