Protein–RNA interactions for Protein: P02545

LMNA, Prelamin-A/C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNAP02545 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMNAP02545 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMNAP02545 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMNAP02545 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMNAP02545 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMNAP02545 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMNAP02545 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMNAP02545 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMNAP02545 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMNAP02545 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMNAP02545 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMNAP02545 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMNAP02545 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMNAP02545 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMNAP02545 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMNAP02545 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMNAP02545 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMNAP02545 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMNAP02545 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LMNAP02545 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMNAP02545 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LMNAP02545 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMNAP02545 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMNAP02545 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMNAP02545 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMNAP02545 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMNAP02545 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMNAP02545 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMNAP02545 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMNAP02545 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LMNAP02545 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMNAP02545 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LMNAP02545 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMNAP02545 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMNAP02545 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMNAP02545 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMNAP02545 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMNAP02545 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMNAP02545 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMNAP02545 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LMNAP02545 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LMNAP02545 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMNAP02545 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMNAP02545 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMNAP02545 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMNAP02545 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMNAP02545 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LMNAP02545 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LMNAP02545 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LMNAP02545 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LMNAP02545 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LMNAP02545 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMNAP02545 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMNAP02545 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMNAP02545 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMNAP02545 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMNAP02545 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMNAP02545 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMNAP02545 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMNAP02545 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMNAP02545 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMNAP02545 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMNAP02545 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMNAP02545 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMNAP02545 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMNAP02545 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LMNAP02545 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMNAP02545 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMNAP02545 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMNAP02545 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMNAP02545 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMNAP02545 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMNAP02545 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMNAP02545 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMNAP02545 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMNAP02545 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMNAP02545 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMNAP02545 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMNAP02545 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMNAP02545 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMNAP02545 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMNAP02545 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMNAP02545 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMNAP02545 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMNAP02545 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMNAP02545 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LMNAP02545 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LMNAP02545 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMNAP02545 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LMNAP02545 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMNAP02545 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMNAP02545 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMNAP02545 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMNAP02545 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMNAP02545 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMNAP02545 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMNAP02545 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMNAP02545 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMNAP02545 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMNAP02545 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.3 ms