Protein–RNA interactions for Protein: O60832

DKC1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKC1O60832 AL603832.3-201ENST00000471038 792 ntTSL 212.41□□□□□ -0.423e-11■■■■■ 44.7
DKC1O60832 AL603832.3-204ENST00000605933 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 512.33□□□□□ -0.443e-11■■■■■ 44.7
DKC1O60832 AL603832.3-203ENST00000606505 813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.443e-11■■■■■ 44.7
DKC1O60832 RHOC-211ENST00000436685 517 ntTSL 510.56□□□□□ -0.723e-11■■■■■ 44.7
DKC1O60832 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.224e-8■■■■■ 44.6
DKC1O60832 EEF1B2-211ENST00000482103 587 ntTSL 24.74□□□□□ -1.651e-323■■■■■ 44.6
DKC1O60832 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.74□□□□□ -1.971e-323■■■■■ 44.6
DKC1O60832 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.322e-6■■■■■ 44.6
DKC1O60832 SMYD3-218ENST00000630181 1458 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.032e-6■■■■■ 44.6
DKC1O60832 NGEF-208ENST00000461944 568 ntTSL 420.58■□□□□ 0.892e-9■■■■■ 44.3
DKC1O60832 NGEF-207ENST00000424488 569 ntTSL 316.48■□□□□ 0.232e-9■■■■■ 44.3
DKC1O60832 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.82■■□□□ 1.081e-323■■■■■ 44.2
DKC1O60832 NCOR2-207ENST00000420698 1752 ntTSL 217.03■□□□□ 0.328e-7■■■■■ 44.1
DKC1O60832 NCOR2-212ENST00000448008 735 ntTSL 515.56■□□□□ 0.088e-7■■■■■ 44.1
DKC1O60832 NCOR2-224ENST00000542927 828 ntTSL 313.9□□□□□ -0.188e-7■■■■■ 44.1
DKC1O60832 TNS3-208ENST00000457718 3836 ntTSL 511.54□□□□□ -0.563e-7■■■■■ 44
DKC1O60832 SNORD91A-202ENST00000609620 191 ntBASIC8.05□□□□□ -1.127e-30■■■■■ 44
DKC1O60832 SNORD91A-201ENST00000390861 95 nt-0.21□□□□□ -2.447e-30■■■■■ 44
DKC1O60832 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.832e-50■■■■■ 44
DKC1O60832 ZNF518A-205ENST00000488700 729 ntTSL 219.56■□□□□ 0.722e-18■■■■■ 44
DKC1O60832 ZNF518A-201ENST00000316045 7277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.752e-18■■■■■ 44
DKC1O60832 ZNF518A-208ENST00000563195 1594 ntTSL 38.48□□□□□ -1.052e-18■■■■■ 44
DKC1O60832 ZNF518A-207ENST00000539666 485 ntTSL 46.45□□□□□ -1.382e-18■■■■■ 44
DKC1O60832 ZNF518A-203ENST00000478086 1579 ntTSL 1 (best)3.62□□□□□ -1.832e-18■■■■■ 44
DKC1O60832 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.222e-18■■■■■ 44
DKC1O60832 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.981e-323■■■■■ 44
DKC1O60832 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.961e-323■■■■■ 44
DKC1O60832 MRPL3-209ENST00000511168 1377 ntTSL 219.47■□□□□ 0.711e-323■■■■■ 44
DKC1O60832 MRPL3-205ENST00000507669 848 ntTSL 315.64■□□□□ 0.091e-323■■■■■ 44
DKC1O60832 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC7.27□□□□□ -1.251e-323■■■■■ 44
DKC1O60832 ZBED3-203ENST00000511587 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 325.38■■□□□ 1.651e-323■■■■■ 44
DKC1O60832 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.221e-323■■■■■ 44
DKC1O60832 SNORA47-201ENST00000458862 138 ntBASIC14.96□□□□□ -0.011e-323■■■■■ 44
DKC1O60832 ZBED3-202ENST00000505685 432 ntTSL 310.53□□□□□ -0.721e-323■■■■■ 44
DKC1O60832 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.368e-7■■■■■ 43.9
DKC1O60832 THAP9-AS1-207ENST00000507660 550 ntTSL 311.51□□□□□ -0.573e-60■■■■■ 43.9
DKC1O60832 THAP9-AS1-212ENST00000513581 683 ntTSL 211.14□□□□□ -0.633e-60■■■■■ 43.9
DKC1O60832 THAP9-AS1-206ENST00000505028 552 ntTSL 47.79□□□□□ -1.163e-60■■■■■ 43.9
DKC1O60832 THAP9-AS1-203ENST00000504718 573 ntTSL 47.37□□□□□ -1.233e-60■■■■■ 43.9
DKC1O60832 SNX29-204ENST00000564791 1633 ntTSL 1 (best)12.48□□□□□ -0.412e-6■■■■■ 43.8
DKC1O60832 SNX29-205ENST00000566228 8171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.482e-6■■■■■ 43.8
DKC1O60832 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.822e-8■■■■■ 43.8
DKC1O60832 STX8-212ENST00000575858 638 ntTSL 38.63□□□□□ -1.032e-8■■■■■ 43.8
DKC1O60832 STX8-211ENST00000575294 454 ntTSL 58.62□□□□□ -1.032e-8■■■■■ 43.8
DKC1O60832 STX8-209ENST00000574431 731 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.052e-8■■■■■ 43.8
DKC1O60832 STX8-202ENST00000570583 367 ntTSL 54.82□□□□□ -1.642e-8■■■■■ 43.8
DKC1O60832 TBRG4-207ENST00000477328 596 ntTSL 213.43□□□□□ -0.261e-6■■■■■ 43.7
DKC1O60832 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC3.1□□□□□ -1.911e-6■■■■■ 43.7
DKC1O60832 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.395e-7■■■■■ 43.7
DKC1O60832 MSI2-207ENST00000579205 500 ntTSL 416.63■□□□□ 0.255e-7■■■■■ 43.7
DKC1O60832 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.245e-7■■■■■ 43.7
DKC1O60832 MSI2-215ENST00000582453 496 ntTSL 33.2□□□□□ -1.95e-7■■■■■ 43.7
DKC1O60832 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.062e-7■■■■■ 43.6
DKC1O60832 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.192e-7■■■■■ 43.6
DKC1O60832 SHANK2-209ENST00000445654 522 ntTSL 315.6■□□□□ 0.091e-7■■■■■ 43.6
DKC1O60832 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.881e-61■■■■■ 43.5
DKC1O60832 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.585e-14■■■■■ 43.5
DKC1O60832 ZNF565-207ENST00000591473 1217 ntTSL 1 (best)16.71■□□□□ 0.276e-8■■■■■ 43.5
DKC1O60832 ZNF565-202ENST00000355114 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.66e-8■■■■■ 43.5
DKC1O60832 RAPGEFL1-201ENST00000264644 3429 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.715e-14■■■■■ 43.5
DKC1O60832 ZNF565-203ENST00000392173 1931 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.86e-8■■■■■ 43.5
DKC1O60832 ZNF565-201ENST00000304116 2023 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.876e-8■■■■■ 43.5
DKC1O60832 ZNF565-206ENST00000587803 566 ntTSL 49.11□□□□□ -0.956e-8■■■■■ 43.5
DKC1O60832 ZNF565-205ENST00000586648 446 ntTSL 1 (best)4.26□□□□□ -1.736e-8■■■■■ 43.5
DKC1O60832 SAMD4A-206ENST00000555091 547 ntTSL 48.56□□□□□ -1.042e-13■■■■■ 43.4
DKC1O60832 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.662e-7■■■■■ 43.4
DKC1O60832 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.812e-7■■■■■ 43.4
DKC1O60832 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.042e-7■■■■■ 43.4
DKC1O60832 HDAC4-209ENST00000487617 819 ntTSL 322.94■■□□□ 1.263e-8■■■■■ 43.4
DKC1O60832 MYO1D-204ENST00000577352 1008 ntTSL 219.42■□□□□ 0.71e-6■■■■■ 43.3
DKC1O60832 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.531e-6■■■■■ 43.3
DKC1O60832 MYO1D-202ENST00000394649 5451 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.091e-6■■■■■ 43.3
DKC1O60832 VGLL4-206ENST00000418000 792 ntTSL 327.99■■■□□ 2.073e-9■■■■■ 43.3
DKC1O60832 VGLL4-205ENST00000417466 894 ntTSL 325.07■■□□□ 1.63e-9■■■■■ 43.3
DKC1O60832 VGLL4-204ENST00000417206 581 ntTSL 420.18■□□□□ 0.823e-9■■■■■ 43.3
DKC1O60832 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.813e-9■■■■■ 43.3
DKC1O60832 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.633e-9■■■■■ 43.3
DKC1O60832 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.363e-9■■■■■ 43.3
DKC1O60832 VGLL4-212ENST00000437722 544 ntTSL 317.2■□□□□ 0.343e-9■■■■■ 43.3
DKC1O60832 VGLL4-209ENST00000424709 437 ntTSL 316.79■□□□□ 0.283e-9■■■■■ 43.3
DKC1O60832 VGLL4-215ENST00000458499 766 ntTSL 315.66■□□□□ 0.13e-9■■■■■ 43.3
DKC1O60832 VGLL4-207ENST00000419541 466 ntTSL 315.66■□□□□ 0.13e-9■■■■■ 43.3
DKC1O60832 VGLL4-201ENST00000273038 3725 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.413e-9■■■■■ 43.3
DKC1O60832 VGLL4-213ENST00000445411 726 ntTSL 510.6□□□□□ -0.713e-9■■■■■ 43.3
DKC1O60832 TAF1D-206ENST00000527068 1023 ntTSL 55.5□□□□□ -1.531e-323■■■■■ 43.3
DKC1O60832 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.151e-323■■■■■ 43.2
DKC1O60832 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.381e-323■■■■■ 43.2
DKC1O60832 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.241e-323■■■■■ 43.2
DKC1O60832 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.21e-323■■■■■ 43.2
DKC1O60832 PABPC4-205ENST00000421687 1663 ntTSL 515.74■□□□□ 0.111e-323■■■■■ 43.2
DKC1O60832 PABPC4-218ENST00000513632 738 ntTSL 210.21□□□□□ -0.771e-323■■■■■ 43.2
DKC1O60832 SNORA55-201ENST00000364587 135 ntBASIC9.69□□□□□ -0.861e-323■■■■■ 43.2
DKC1O60832 PABPC4-220ENST00000525669 582 ntTSL 29.66□□□□□ -0.861e-323■■■■■ 43.2
DKC1O60832 PABPC4-222ENST00000527718 746 ntTSL 57.04□□□□□ -1.281e-323■■■■■ 43.2
DKC1O60832 PABPC4-210ENST00000470443 1212 ntTSL 56.72□□□□□ -1.331e-323■■■■■ 43.2
DKC1O60832 EIF4A1-228ENST00000583389 951 ntTSL 316.39■□□□□ 0.211e-323■■■■■ 43.2
DKC1O60832 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.487e-11■■■■■ 43.1
DKC1O60832 C2orf48-202ENST00000619640 480 ntTSL 1 (best)17.21■□□□□ 0.357e-11■■■■■ 43.1
DKC1O60832 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.137e-11■■■■■ 43.1
DKC1O60832 SLC2A10-203ENST00000611837 586 ntTSL 219.41■□□□□ 0.72e-10■■■■■ 43
Retrieved 100 of 8,567 protein–RNA pairs in 501.7 ms