RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430365.6

VGLL4-211, Transcript of vestigial like family member 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene VGLL4, Length 1,377 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL4-211ENST00000430365 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.43■■■■■ 4.06
VGLL4-211ENST00000430365 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.88■■■■□ 3.33
VGLL4-211ENST00000430365 ABCC9O60706 1549 aa35.08■■■■□ 3.21
VGLL4-211ENST00000430365 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.96■■■■□ 3.03
VGLL4-211ENST00000430365 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.81■■■■□ 3
VGLL4-211ENST00000430365 NACADO15069 1562 aa33.78■■■■□ 3
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VGLL4-211ENST00000430365 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.59■■■□□ 2.97
VGLL4-211ENST00000430365 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.46■■■□□ 2.95
VGLL4-211ENST00000430365 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.84■■■□□ 2.85
VGLL4-211ENST00000430365 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.83■■■□□ 2.85
VGLL4-211ENST00000430365 SCRIBQ14160 1630 aa32.75■■■□□ 2.83
VGLL4-211ENST00000430365 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.63■■■□□ 2.81
VGLL4-211ENST00000430365 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.45■■■□□ 2.79
VGLL4-211ENST00000430365 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.06■■■□□ 2.72
VGLL4-211ENST00000430365 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.85■■■□□ 2.69
VGLL4-211ENST00000430365 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.69■■■□□ 2.66
VGLL4-211ENST00000430365 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.53■■■□□ 2.64
VGLL4-211ENST00000430365 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.37■■■□□ 2.61
VGLL4-211ENST00000430365 SMARCA4P51532 1647 aa31.32■■■□□ 2.6
VGLL4-211ENST00000430365 SMARCA2P51531 1590 aa31.18■■■□□ 2.58
VGLL4-211ENST00000430365 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.17■■■□□ 2.58
VGLL4-211ENST00000430365 NCAPD3P42695 1498 aa31.16■■■□□ 2.58
VGLL4-211ENST00000430365 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.12■■■□□ 2.57
VGLL4-211ENST00000430365 PEG3Q9GZU2 1588 aa31■■■□□ 2.55
VGLL4-211ENST00000430365 HMGXB3Q12766 1538 aa30.99■■■□□ 2.55
VGLL4-211ENST00000430365 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.97■■■□□ 2.55
VGLL4-211ENST00000430365 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.84■■■□□ 2.53
VGLL4-211ENST00000430365 WIZO95785 1651 aa30.77■■■□□ 2.52
VGLL4-211ENST00000430365 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.51■■■□□ 2.47
VGLL4-211ENST00000430365 ERCC6Q03468 1493 aa30.33■■■□□ 2.45
VGLL4-211ENST00000430365 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.33■■■□□ 2.45
VGLL4-211ENST00000430365 NESP48681 1621 aa30.32■■■□□ 2.44
VGLL4-211ENST00000430365 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.31■■■□□ 2.44
VGLL4-211ENST00000430365 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.27■■■□□ 2.44
VGLL4-211ENST00000430365 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.22■■■□□ 2.43
VGLL4-211ENST00000430365 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.16■■■□□ 2.42
VGLL4-211ENST00000430365 CFTRP13569 1480 aa30.09■■■□□ 2.41
VGLL4-211ENST00000430365 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.93■■■□□ 2.38
VGLL4-211ENST00000430365 CUX2O14529 1486 aa29.92■■■□□ 2.38
VGLL4-211ENST00000430365 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.92■■■□□ 2.38
VGLL4-211ENST00000430365 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.9■■■□□ 2.38
VGLL4-211ENST00000430365 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.82■■■□□ 2.36
VGLL4-211ENST00000430365 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
VGLL4-211ENST00000430365 PRDM2Q13029 1718 aa29.77■■■□□ 2.36
VGLL4-211ENST00000430365 WDR62O43379 1518 aa29.66■■■□□ 2.34
VGLL4-211ENST00000430365 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
VGLL4-211ENST00000430365 ABCC8Q09428 1581 aa29.54■■■□□ 2.32
VGLL4-211ENST00000430365 TOPBP1Q92547 1522 aa29.43■■■□□ 2.3
VGLL4-211ENST00000430365 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.4■■■□□ 2.3
VGLL4-211ENST00000430365 IFT140Q96RY7 1462 aa29.28■■■□□ 2.28
VGLL4-211ENST00000430365 CUX1P39880 1505 aa29.2■■■□□ 2.26
VGLL4-211ENST00000430365 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
VGLL4-211ENST00000430365 SOGA1O94964 1423 aa29.15■■■□□ 2.26
VGLL4-211ENST00000430365 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.14■■■□□ 2.26
VGLL4-211ENST00000430365 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.13■■■□□ 2.25
VGLL4-211ENST00000430365 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
VGLL4-211ENST00000430365 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.05■■■□□ 2.24
VGLL4-211ENST00000430365 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
VGLL4-211ENST00000430365 TOP2BQ02880 1626 aa28.99■■■□□ 2.23
VGLL4-211ENST00000430365 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.96■■■□□ 2.23
VGLL4-211ENST00000430365 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.95■■■□□ 2.233e-7■■■■■ 36.6
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VGLL4-211ENST00000430365 SYNJ1O43426 1573 aa28.94■■■□□ 2.22
VGLL4-211ENST00000430365 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
VGLL4-211ENST00000430365 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.92■■■□□ 2.22
VGLL4-211ENST00000430365 WDR97A6NE52 1622 aa28.9■■■□□ 2.22
VGLL4-211ENST00000430365 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.86■■■□□ 2.21
VGLL4-211ENST00000430365 OSCARQ8IYS5 282 aa28.8■■■□□ 2.2
VGLL4-211ENST00000430365 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.78■■■□□ 2.2
VGLL4-211ENST00000430365 GRIN2BQ13224 1484 aa28.78■■■□□ 2.2
VGLL4-211ENST00000430365 FBLN2P98095 1184 aa28.74■■■□□ 2.19
VGLL4-211ENST00000430365 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.68■■■□□ 2.18
VGLL4-211ENST00000430365 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
VGLL4-211ENST00000430365 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
VGLL4-211ENST00000430365 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.67■■■□□ 2.18
VGLL4-211ENST00000430365 TRIM41Q8WV44 630 aa28.62■■■□□ 2.17
VGLL4-211ENST00000430365 PBRM1Q86U86 1689 aa28.61■■■□□ 2.17
VGLL4-211ENST00000430365 KIF27Q86VH2 1401 aa28.57■■■□□ 2.16
VGLL4-211ENST00000430365 SYNJ2O15056 1496 aa28.56■■■□□ 2.16
VGLL4-211ENST00000430365 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.53■■■□□ 2.16
VGLL4-211ENST00000430365 CHD1O14646 1710 aa28.52■■■□□ 2.16
VGLL4-211ENST00000430365 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.47■■■□□ 2.15
VGLL4-211ENST00000430365 ADAMTS12P58397 1594 aa28.4■■■□□ 2.14
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VGLL4-211ENST00000430365 GRIN2AQ12879 1464 aa28.37■■■□□ 2.13
VGLL4-211ENST00000430365 CUL7Q14999 1698 aa28.28■■■□□ 2.12
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VGLL4-211ENST00000430365 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.23■■■□□ 2.11
VGLL4-211ENST00000430365 NUP160Q12769 1436 aa28.22■■■□□ 2.11
VGLL4-211ENST00000430365 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.22■■■□□ 2.11
VGLL4-211ENST00000430365 ARHGEF11O15085 1522 aa28.18■■■□□ 2.1
VGLL4-211ENST00000430365 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.18■■■□□ 2.1
VGLL4-211ENST00000430365 CEP170Q5SW79 1584 aa28.15■■■□□ 2.1
VGLL4-211ENST00000430365 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.14■■■□□ 2.1
VGLL4-211ENST00000430365 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.14■■■□□ 2.1
VGLL4-211ENST00000430365 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.14■■■□□ 2.1
VGLL4-211ENST00000430365 EEA1Q15075 1411 aa28.09■■■□□ 2.09
VGLL4-211ENST00000430365 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.09■■■□□ 2.09
VGLL4-211ENST00000430365 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.06■■■□□ 2.08
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