RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417466.5

VGLL4-205, Transcript of vestigial like family member 4, humanhuman

TSL 3

Gene VGLL4, Length 894 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL4-205ENST00000417466 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.19■■■■■ 6.59
VGLL4-205ENST00000417466 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.41■■■■■ 5.66
VGLL4-205ENST00000417466 ABCC9O60706 1549 aa50.36■■■■■ 5.65
VGLL4-205ENST00000417466 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.96■■■■■ 5.27
VGLL4-205ENST00000417466 NACADO15069 1562 aa47.63■■■■■ 5.22
VGLL4-205ENST00000417466 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.39■■■■■ 5.18
VGLL4-205ENST00000417466 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.25■■■■■ 5.15
VGLL4-205ENST00000417466 MYO15BQ96JP2 1530 aa47■■■■■ 5.12
VGLL4-205ENST00000417466 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.93■■■■■ 5.1
VGLL4-205ENST00000417466 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.9■■■■■ 5.1
VGLL4-205ENST00000417466 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.6■■■■■ 5.05
VGLL4-205ENST00000417466 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.57■■■■■ 5.04
VGLL4-205ENST00000417466 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.42■■■■■ 5.02
VGLL4-205ENST00000417466 SCRIBQ14160 1630 aa45.92■■■■■ 4.94
VGLL4-205ENST00000417466 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.92■■■■■ 4.94
VGLL4-205ENST00000417466 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.51■■■■■ 4.88
VGLL4-205ENST00000417466 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.41■■■■■ 4.86
VGLL4-205ENST00000417466 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.36■■■■■ 4.85
VGLL4-205ENST00000417466 NCAPD3P42695 1498 aa43.99■■■■■ 4.63
VGLL4-205ENST00000417466 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.85■■■■■ 4.61
VGLL4-205ENST00000417466 SMARCA4P51532 1647 aa43.83■■■■■ 4.61
VGLL4-205ENST00000417466 SMARCA2P51531 1590 aa43.72■■■■■ 4.59
VGLL4-205ENST00000417466 HMGXB3Q12766 1538 aa43.65■■■■■ 4.58
VGLL4-205ENST00000417466 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.6■■■■■ 4.57
VGLL4-205ENST00000417466 ERCC6Q03468 1493 aa43.45■■■■■ 4.55
VGLL4-205ENST00000417466 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.41■■■■■ 4.54
VGLL4-205ENST00000417466 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.41■■■■■ 4.54
VGLL4-205ENST00000417466 CUX2O14529 1486 aa43.38■■■■■ 4.53
VGLL4-205ENST00000417466 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.33■■■■■ 4.53
VGLL4-205ENST00000417466 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.31■■■■■ 4.52
VGLL4-205ENST00000417466 NESP48681 1621 aa43.29■■■■■ 4.52
VGLL4-205ENST00000417466 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.99■■■■■ 4.47
VGLL4-205ENST00000417466 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.84■■■■■ 4.45
VGLL4-205ENST00000417466 WIZO95785 1651 aa42.8■■■■■ 4.44
VGLL4-205ENST00000417466 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.74■■■■■ 4.43
VGLL4-205ENST00000417466 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.72■■■■■ 4.43
VGLL4-205ENST00000417466 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.65■■■■■ 4.42
VGLL4-205ENST00000417466 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.42■■■■■ 4.38
VGLL4-205ENST00000417466 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.35■■■■■ 4.37
VGLL4-205ENST00000417466 WDR62O43379 1518 aa42.25■■■■■ 4.35
VGLL4-205ENST00000417466 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.23■■■■■ 4.35
VGLL4-205ENST00000417466 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.19■■■■■ 4.34
VGLL4-205ENST00000417466 CFTRP13569 1480 aa42.17■■■■■ 4.34
VGLL4-205ENST00000417466 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.16■■■■■ 4.34
VGLL4-205ENST00000417466 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.83■■■■■ 4.29
VGLL4-205ENST00000417466 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.78■■■■■ 4.28
VGLL4-205ENST00000417466 PRDM2Q13029 1718 aa41.78■■■■■ 4.28
VGLL4-205ENST00000417466 OSCARQ8IYS5 282 aa41.42■■■■■ 4.22
VGLL4-205ENST00000417466 TRIM41Q8WV44 630 aa41.42■■■■■ 4.22
VGLL4-205ENST00000417466 TOPBP1Q92547 1522 aa41.37■■■■■ 4.21
VGLL4-205ENST00000417466 IFT140Q96RY7 1462 aa41.34■■■■■ 4.21
VGLL4-205ENST00000417466 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.3■■■■■ 4.2
VGLL4-205ENST00000417466 ABCC8Q09428 1581 aa41.28■■■■■ 4.2
VGLL4-205ENST00000417466 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.22■■■■■ 4.19
VGLL4-205ENST00000417466 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.07■■■■■ 4.16
VGLL4-205ENST00000417466 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.03■■■■■ 4.16
VGLL4-205ENST00000417466 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.95■■■■■ 4.15
VGLL4-205ENST00000417466 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.93■■■■■ 4.146e-7■■■■■ 27.3
VGLL4-205ENST00000417466 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.89■■■■■ 4.14
VGLL4-205ENST00000417466 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.89■■■■■ 4.14
VGLL4-205ENST00000417466 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.89■■■■■ 4.14
VGLL4-205ENST00000417466 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.81■■■■■ 4.12
VGLL4-205ENST00000417466 CHD1O14646 1710 aa40.77■■■■■ 4.12
VGLL4-205ENST00000417466 SOGA1O94964 1423 aa40.76■■■■■ 4.12
VGLL4-205ENST00000417466 ARHGEF11O15085 1522 aa40.75■■■■■ 4.11
VGLL4-205ENST00000417466 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.7■■■■■ 4.11
VGLL4-205ENST00000417466 CUX1P39880 1505 aa40.68■■■■■ 4.1
VGLL4-205ENST00000417466 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.68■■■■■ 4.1
VGLL4-205ENST00000417466 FBLN2P98095 1184 aa40.63■■■■■ 4.09
VGLL4-205ENST00000417466 WDR97A6NE52 1622 aa40.58■■■■■ 4.09
VGLL4-205ENST00000417466 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.56■■■■■ 4.08
VGLL4-205ENST00000417466 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.5■■■■■ 4.07
VGLL4-205ENST00000417466 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.45■■■■■ 4.07
VGLL4-205ENST00000417466 GRIN2BQ13224 1484 aa40.4■■■■■ 4.06
VGLL4-205ENST00000417466 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.39■■■■■ 4.06
VGLL4-205ENST00000417466 ARAP1Q96P48 1450 aa40.35■■■■■ 4.05
VGLL4-205ENST00000417466 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.35■■■■■ 4.05
VGLL4-205ENST00000417466 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.3■■■■■ 4.04
VGLL4-205ENST00000417466 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.27■■■■■ 4.04
VGLL4-205ENST00000417466 PBRM1Q86U86 1689 aa40.27■■■■■ 4.04
VGLL4-205ENST00000417466 SYNJ1O43426 1573 aa40.26■■■■■ 4.04
VGLL4-205ENST00000417466 SYNJ2O15056 1496 aa40.26■■■■■ 4.03
VGLL4-205ENST00000417466 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.24■■■■■ 4.03
VGLL4-205ENST00000417466 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.19■■■■■ 4.02
VGLL4-205ENST00000417466 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.08■■■■■ 4.01
VGLL4-205ENST00000417466 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.05■■■■■ 4
VGLL4-205ENST00000417466 TOP2BQ02880 1626 aa40.04■■■■■ 4
VGLL4-205ENST00000417466 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.97■■■■□ 3.99
VGLL4-205ENST00000417466 GRIN2AQ12879 1464 aa39.88■■■■□ 3.98
VGLL4-205ENST00000417466 ADAMTS12P58397 1594 aa39.86■■■■□ 3.97
VGLL4-205ENST00000417466 CEP170Q5SW79 1584 aa39.76■■■■□ 3.95
VGLL4-205ENST00000417466 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.75■■■■□ 3.95
VGLL4-205ENST00000417466 NUP160Q12769 1436 aa39.75■■■■□ 3.95
VGLL4-205ENST00000417466 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.74■■■■□ 3.95
VGLL4-205ENST00000417466 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.69■■■■□ 3.94
VGLL4-205ENST00000417466 SHROOM2Q13796 1616 aa39.59■■■■□ 3.93
VGLL4-205ENST00000417466 JPH4Q96JJ6 628 aa39.36■■■■□ 3.89
VGLL4-205ENST00000417466 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.36■■■■□ 3.89
VGLL4-205ENST00000417466 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.31■■■■□ 3.88
VGLL4-205ENST00000417466 IGF1RP08069 1367 aa39.25■■■■□ 3.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.5 ms