RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418000.5

VGLL4-206, Transcript of vestigial like family member 4, humanhuman

TSL 3

Gene VGLL4, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL4-206ENST00000418000 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.42■■■■■ 7.74
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VGLL4-206ENST00000418000 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa57.1■■■■■ 6.73
VGLL4-206ENST00000418000 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.38■■■■■ 6.3
VGLL4-206ENST00000418000 NACADO15069 1562 aa53.95■■■■■ 6.23
VGLL4-206ENST00000418000 DNAJC5BQ9UF47 199 aa53.86■■■■■ 6.21
VGLL4-206ENST00000418000 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.47■■■■■ 6.15
VGLL4-206ENST00000418000 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53.34■■■■■ 6.13
VGLL4-206ENST00000418000 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP53.17■■■■■ 6.1
VGLL4-206ENST00000418000 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.14■■■■■ 6.1
VGLL4-206ENST00000418000 BICRAQ9NZM4 1560 aa52.88■■■■■ 6.06
VGLL4-206ENST00000418000 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.53■■■■■ 6
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VGLL4-206ENST00000418000 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.05■■■■■ 5.92
VGLL4-206ENST00000418000 SCRIBQ14160 1630 aa51.97■■■■■ 5.91
VGLL4-206ENST00000418000 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.73■■■■■ 5.87
VGLL4-206ENST00000418000 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP51.55■■■■■ 5.84
VGLL4-206ENST00000418000 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.54■■■■■ 5.84
VGLL4-206ENST00000418000 NCAPD3P42695 1498 aa49.78■■■■■ 5.56
VGLL4-206ENST00000418000 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.61■■■■■ 5.53
VGLL4-206ENST00000418000 SMARCA4P51532 1647 aa49.57■■■■■ 5.53
VGLL4-206ENST00000418000 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa49.56■■■■■ 5.52
VGLL4-206ENST00000418000 SMARCA2P51531 1590 aa49.46■■■■■ 5.51
VGLL4-206ENST00000418000 HMGXB3Q12766 1538 aa49.44■■■■■ 5.5
VGLL4-206ENST00000418000 CUX2O14529 1486 aa49.39■■■■■ 5.5
VGLL4-206ENST00000418000 ERCC6Q03468 1493 aa49.36■■■■■ 5.49
VGLL4-206ENST00000418000 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.24■■■■■ 5.47
VGLL4-206ENST00000418000 NESP48681 1621 aa49.12■■■■■ 5.45
VGLL4-206ENST00000418000 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.11■■■■■ 5.45
VGLL4-206ENST00000418000 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.09■■■■■ 5.45
VGLL4-206ENST00000418000 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.89■■■■■ 5.42
VGLL4-206ENST00000418000 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.74■■■■■ 5.39
VGLL4-206ENST00000418000 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.73■■■■■ 5.39
VGLL4-206ENST00000418000 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.58■■■■■ 5.37
VGLL4-206ENST00000418000 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.37■■■■■ 5.33
VGLL4-206ENST00000418000 WIZO95785 1651 aa48.34■■■■■ 5.33
VGLL4-206ENST00000418000 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.23■■■■■ 5.31
VGLL4-206ENST00000418000 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.03■■■■■ 5.28
VGLL4-206ENST00000418000 WDR62O43379 1518 aa47.96■■■■■ 5.27
VGLL4-206ENST00000418000 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.78■■■■■ 5.24
VGLL4-206ENST00000418000 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.75■■■■■ 5.23
VGLL4-206ENST00000418000 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.71■■■■■ 5.23
VGLL4-206ENST00000418000 CFTRP13569 1480 aa47.67■■■■■ 5.22
VGLL4-206ENST00000418000 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.66■■■■■ 5.22
VGLL4-206ENST00000418000 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.38■■■■■ 5.18
VGLL4-206ENST00000418000 PRDM2Q13029 1718 aa47.36■■■■■ 5.17
VGLL4-206ENST00000418000 TRIM41Q8WV44 630 aa47.27■■■■■ 5.16
VGLL4-206ENST00000418000 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.09■■■■■ 5.13
VGLL4-206ENST00000418000 OSCARQ8IYS5 282 aa47.01■■■■■ 5.12
VGLL4-206ENST00000418000 IFT140Q96RY7 1462 aa46.82■■■■■ 5.09
VGLL4-206ENST00000418000 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.82■■■■■ 5.09
VGLL4-206ENST00000418000 TOPBP1Q92547 1522 aa46.81■■■■■ 5.08
VGLL4-206ENST00000418000 ABCC8Q09428 1581 aa46.64■■■■■ 5.06
VGLL4-206ENST00000418000 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.64■■■■■ 5.06
VGLL4-206ENST00000418000 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.6■■■■■ 5.05
VGLL4-206ENST00000418000 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa46.59■■■■■ 5.05
VGLL4-206ENST00000418000 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa46.59■■■■■ 5.05
VGLL4-206ENST00000418000 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa46.59■■■■■ 5.05
VGLL4-206ENST00000418000 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.47■■■■■ 5.03
VGLL4-206ENST00000418000 ARHGEF11O15085 1522 aa46.37■■■■■ 5.01
VGLL4-206ENST00000418000 CHD1O14646 1710 aa46.35■■■■■ 5.01
VGLL4-206ENST00000418000 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.33■■■■■ 5.013e-7■■■■□ 23.7
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VGLL4-206ENST00000418000 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.14■■■■■ 4.98
VGLL4-206ENST00000418000 SOGA1O94964 1423 aa46.04■■■■■ 4.96
VGLL4-206ENST00000418000 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46■■■■■ 4.95
VGLL4-206ENST00000418000 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.98■■■■■ 4.95
VGLL4-206ENST00000418000 FBLN2P98095 1184 aa45.98■■■■■ 4.95
VGLL4-206ENST00000418000 WDR97A6NE52 1622 aa45.95■■■■■ 4.95
VGLL4-206ENST00000418000 CUX1P39880 1505 aa45.94■■■■■ 4.95
VGLL4-206ENST00000418000 CYB5RLQ6IPT4 315 aa45.94■■■■■ 4.94
VGLL4-206ENST00000418000 ARAP1Q96P48 1450 aa45.9■■■■■ 4.94
VGLL4-206ENST00000418000 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.87■■■■■ 4.93
VGLL4-206ENST00000418000 CLASP1Q7Z460 1538 aa45.75■■■■■ 4.91
VGLL4-206ENST00000418000 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.73■■■■■ 4.91
VGLL4-206ENST00000418000 GRIN2BQ13224 1484 aa45.69■■■■■ 4.91
VGLL4-206ENST00000418000 SYNJ1O43426 1573 aa45.66■■■■■ 4.9
VGLL4-206ENST00000418000 PBRM1Q86U86 1689 aa45.64■■■■■ 4.9
VGLL4-206ENST00000418000 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.61■■■■■ 4.89
VGLL4-206ENST00000418000 SYNJ2O15056 1496 aa45.58■■■■■ 4.89
VGLL4-206ENST00000418000 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.51■■■■■ 4.88
VGLL4-206ENST00000418000 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.48■■■■■ 4.87
VGLL4-206ENST00000418000 TRHP20396 242 aaPredicted RBP45.47■■■■■ 4.87
VGLL4-206ENST00000418000 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.46■■■■■ 4.87
VGLL4-206ENST00000418000 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.38■■■■■ 4.86
VGLL4-206ENST00000418000 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.21■■■■■ 4.83
VGLL4-206ENST00000418000 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.17■■■■■ 4.82
VGLL4-206ENST00000418000 TOP2BQ02880 1626 aa45.16■■■■■ 4.82
VGLL4-206ENST00000418000 ADAMTS12P58397 1594 aa45.13■■■■■ 4.82
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VGLL4-206ENST00000418000 CEP170Q5SW79 1584 aa45.03■■■■■ 4.8
VGLL4-206ENST00000418000 ERCC6L2Q5T890 1561 aa45.03■■■■■ 4.8
VGLL4-206ENST00000418000 NUP160Q12769 1436 aa44.99■■■■■ 4.79
VGLL4-206ENST00000418000 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.91■■■■■ 4.78
VGLL4-206ENST00000418000 SHROOM2Q13796 1616 aa44.9■■■■■ 4.78
VGLL4-206ENST00000418000 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.88■■■■■ 4.78
VGLL4-206ENST00000418000 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP44.54■■■■■ 4.72
VGLL4-206ENST00000418000 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.51■■■■■ 4.72
VGLL4-206ENST00000418000 KIF13AQ9H1H9 1805 aa44.47■■■■■ 4.71
VGLL4-206ENST00000418000 JPH4Q96JJ6 628 aa44.44■■■■■ 4.7
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