Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMARCA5O60264 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCA5O60264 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCA5O60264 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCA5O60264 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCA5O60264 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCA5O60264 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCA5O60264 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCA5O60264 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCA5O60264 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCA5O60264 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCA5O60264 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCA5O60264 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCA5O60264 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCA5O60264 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCA5O60264 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCA5O60264 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCA5O60264 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCA5O60264 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCA5O60264 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCA5O60264 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMARCA5O60264 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMARCA5O60264 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMARCA5O60264 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMARCA5O60264 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMARCA5O60264 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMARCA5O60264 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMARCA5O60264 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMARCA5O60264 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMARCA5O60264 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMARCA5O60264 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMARCA5O60264 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMARCA5O60264 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMARCA5O60264 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SMARCA5O60264 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SMARCA5O60264 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMARCA5O60264 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMARCA5O60264 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMARCA5O60264 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SMARCA5O60264 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMARCA5O60264 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMARCA5O60264 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMARCA5O60264 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMARCA5O60264 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMARCA5O60264 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMARCA5O60264 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMARCA5O60264 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMARCA5O60264 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMARCA5O60264 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMARCA5O60264 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SMARCA5O60264 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMARCA5O60264 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMARCA5O60264 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMARCA5O60264 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMARCA5O60264 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMARCA5O60264 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMARCA5O60264 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SMARCA5O60264 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMARCA5O60264 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMARCA5O60264 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMARCA5O60264 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMARCA5O60264 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMARCA5O60264 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMARCA5O60264 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMARCA5O60264 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMARCA5O60264 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMARCA5O60264 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMARCA5O60264 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMARCA5O60264 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMARCA5O60264 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMARCA5O60264 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMARCA5O60264 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMARCA5O60264 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMARCA5O60264 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMARCA5O60264 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMARCA5O60264 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMARCA5O60264 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMARCA5O60264 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMARCA5O60264 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMARCA5O60264 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMARCA5O60264 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMARCA5O60264 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMARCA5O60264 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMARCA5O60264 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMARCA5O60264 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMARCA5O60264 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMARCA5O60264 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMARCA5O60264 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMARCA5O60264 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMARCA5O60264 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMARCA5O60264 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMARCA5O60264 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMARCA5O60264 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMARCA5O60264 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMARCA5O60264 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMARCA5O60264 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMARCA5O60264 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMARCA5O60264 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMARCA5O60264 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMARCA5O60264 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms