Protein–RNA interactions for Protein: O00750

PIK3C2B, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2BO00750 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PIK3C2BO00750 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
PIK3C2BO00750 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PIK3C2BO00750 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PIK3C2BO00750 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PIK3C2BO00750 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
PIK3C2BO00750 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PIK3C2BO00750 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PIK3C2BO00750 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PIK3C2BO00750 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PIK3C2BO00750 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PIK3C2BO00750 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
PIK3C2BO00750 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PIK3C2BO00750 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PIK3C2BO00750 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PIK3C2BO00750 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PIK3C2BO00750 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PIK3C2BO00750 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PIK3C2BO00750 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PIK3C2BO00750 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PIK3C2BO00750 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PIK3C2BO00750 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PIK3C2BO00750 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
PIK3C2BO00750 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PIK3C2BO00750 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
PIK3C2BO00750 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PIK3C2BO00750 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PIK3C2BO00750 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PIK3C2BO00750 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PIK3C2BO00750 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PIK3C2BO00750 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PIK3C2BO00750 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
PIK3C2BO00750 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PIK3C2BO00750 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PIK3C2BO00750 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PIK3C2BO00750 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PIK3C2BO00750 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PIK3C2BO00750 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PIK3C2BO00750 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
PIK3C2BO00750 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PIK3C2BO00750 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PIK3C2BO00750 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PIK3C2BO00750 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PIK3C2BO00750 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PIK3C2BO00750 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PIK3C2BO00750 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PIK3C2BO00750 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PIK3C2BO00750 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PIK3C2BO00750 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PIK3C2BO00750 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PIK3C2BO00750 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PIK3C2BO00750 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PIK3C2BO00750 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
PIK3C2BO00750 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PIK3C2BO00750 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
PIK3C2BO00750 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
PIK3C2BO00750 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
PIK3C2BO00750 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PIK3C2BO00750 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PIK3C2BO00750 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PIK3C2BO00750 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PIK3C2BO00750 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
PIK3C2BO00750 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
PIK3C2BO00750 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PIK3C2BO00750 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PIK3C2BO00750 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PIK3C2BO00750 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PIK3C2BO00750 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PIK3C2BO00750 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PIK3C2BO00750 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PIK3C2BO00750 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PIK3C2BO00750 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PIK3C2BO00750 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
PIK3C2BO00750 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PIK3C2BO00750 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PIK3C2BO00750 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PIK3C2BO00750 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PIK3C2BO00750 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PIK3C2BO00750 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PIK3C2BO00750 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PIK3C2BO00750 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PIK3C2BO00750 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PIK3C2BO00750 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PIK3C2BO00750 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
PIK3C2BO00750 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
PIK3C2BO00750 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PIK3C2BO00750 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PIK3C2BO00750 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PIK3C2BO00750 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PIK3C2BO00750 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PIK3C2BO00750 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PIK3C2BO00750 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PIK3C2BO00750 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PIK3C2BO00750 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
PIK3C2BO00750 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PIK3C2BO00750 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PIK3C2BO00750 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
PIK3C2BO00750 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PIK3C2BO00750 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
PIK3C2BO00750 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms