Protein–RNA interactions for Protein: H3BQF6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQF6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
H3BQF6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
H3BQF6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
H3BQF6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
H3BQF6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
H3BQF6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
H3BQF6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
H3BQF6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
H3BQF6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
H3BQF6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
H3BQF6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
H3BQF6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
H3BQF6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
H3BQF6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
H3BQF6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
H3BQF6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
H3BQF6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
H3BQF6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
H3BQF6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
H3BQF6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
H3BQF6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
H3BQF6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
H3BQF6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H3BQF6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
H3BQF6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H3BQF6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
H3BQF6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
H3BQF6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H3BQF6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H3BQF6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H3BQF6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H3BQF6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
H3BQF6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H3BQF6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
H3BQF6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H3BQF6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
H3BQF6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H3BQF6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
H3BQF6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H3BQF6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H3BQF6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H3BQF6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
H3BQF6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
H3BQF6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H3BQF6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H3BQF6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
H3BQF6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H3BQF6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
H3BQF6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H3BQF6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H3BQF6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
H3BQF6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
H3BQF6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H3BQF6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H3BQF6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
H3BQF6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
H3BQF6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
H3BQF6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H3BQF6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
H3BQF6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H3BQF6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
H3BQF6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H3BQF6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
H3BQF6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
H3BQF6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
H3BQF6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
H3BQF6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
H3BQF6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H3BQF6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
H3BQF6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H3BQF6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
H3BQF6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
H3BQF6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
H3BQF6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
H3BQF6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
H3BQF6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
H3BQF6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H3BQF6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H3BQF6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H3BQF6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H3BQF6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
H3BQF6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H3BQF6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
H3BQF6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H3BQF6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H3BQF6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
H3BQF6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H3BQF6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
H3BQF6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
H3BQF6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
H3BQF6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H3BQF6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H3BQF6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
H3BQF6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H3BQF6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
H3BQF6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
H3BQF6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
H3BQF6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H3BQF6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
H3BQF6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.5 ms