Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BHMG1C9JSJ3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BHMG1C9JSJ3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BHMG1C9JSJ3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BHMG1C9JSJ3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
BHMG1C9JSJ3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BHMG1C9JSJ3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BHMG1C9JSJ3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BHMG1C9JSJ3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BHMG1C9JSJ3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BHMG1C9JSJ3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BHMG1C9JSJ3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BHMG1C9JSJ3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
BHMG1C9JSJ3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BHMG1C9JSJ3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BHMG1C9JSJ3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BHMG1C9JSJ3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BHMG1C9JSJ3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BHMG1C9JSJ3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BHMG1C9JSJ3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BHMG1C9JSJ3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BHMG1C9JSJ3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BHMG1C9JSJ3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
BHMG1C9JSJ3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
BHMG1C9JSJ3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BHMG1C9JSJ3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BHMG1C9JSJ3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BHMG1C9JSJ3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BHMG1C9JSJ3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BHMG1C9JSJ3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BHMG1C9JSJ3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BHMG1C9JSJ3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BHMG1C9JSJ3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BHMG1C9JSJ3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BHMG1C9JSJ3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
BHMG1C9JSJ3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
BHMG1C9JSJ3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
BHMG1C9JSJ3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BHMG1C9JSJ3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BHMG1C9JSJ3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BHMG1C9JSJ3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BHMG1C9JSJ3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BHMG1C9JSJ3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BHMG1C9JSJ3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BHMG1C9JSJ3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BHMG1C9JSJ3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BHMG1C9JSJ3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BHMG1C9JSJ3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BHMG1C9JSJ3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BHMG1C9JSJ3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BHMG1C9JSJ3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BHMG1C9JSJ3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BHMG1C9JSJ3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BHMG1C9JSJ3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BHMG1C9JSJ3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BHMG1C9JSJ3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BHMG1C9JSJ3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BHMG1C9JSJ3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BHMG1C9JSJ3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BHMG1C9JSJ3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BHMG1C9JSJ3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BHMG1C9JSJ3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BHMG1C9JSJ3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BHMG1C9JSJ3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BHMG1C9JSJ3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BHMG1C9JSJ3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BHMG1C9JSJ3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BHMG1C9JSJ3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BHMG1C9JSJ3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BHMG1C9JSJ3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BHMG1C9JSJ3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BHMG1C9JSJ3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BHMG1C9JSJ3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BHMG1C9JSJ3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BHMG1C9JSJ3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BHMG1C9JSJ3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BHMG1C9JSJ3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BHMG1C9JSJ3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BHMG1C9JSJ3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BHMG1C9JSJ3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BHMG1C9JSJ3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BHMG1C9JSJ3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BHMG1C9JSJ3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BHMG1C9JSJ3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BHMG1C9JSJ3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BHMG1C9JSJ3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BHMG1C9JSJ3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BHMG1C9JSJ3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BHMG1C9JSJ3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BHMG1C9JSJ3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BHMG1C9JSJ3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BHMG1C9JSJ3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BHMG1C9JSJ3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BHMG1C9JSJ3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BHMG1C9JSJ3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BHMG1C9JSJ3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BHMG1C9JSJ3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BHMG1C9JSJ3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BHMG1C9JSJ3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BHMG1C9JSJ3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms