Protein–RNA interactions for Protein: B7Z1M9

C2CD4D, C2 calcium-dependent domain-containing protein 4D, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2CD4DB7Z1M9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C2CD4DB7Z1M9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C2CD4DB7Z1M9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C2CD4DB7Z1M9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C2CD4DB7Z1M9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C2CD4DB7Z1M9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
C2CD4DB7Z1M9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C2CD4DB7Z1M9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C2CD4DB7Z1M9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
C2CD4DB7Z1M9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C2CD4DB7Z1M9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C2CD4DB7Z1M9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C2CD4DB7Z1M9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C2CD4DB7Z1M9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C2CD4DB7Z1M9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
C2CD4DB7Z1M9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C2CD4DB7Z1M9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C2CD4DB7Z1M9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C2CD4DB7Z1M9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C2CD4DB7Z1M9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C2CD4DB7Z1M9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C2CD4DB7Z1M9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C2CD4DB7Z1M9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C2CD4DB7Z1M9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C2CD4DB7Z1M9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C2CD4DB7Z1M9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C2CD4DB7Z1M9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C2CD4DB7Z1M9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C2CD4DB7Z1M9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C2CD4DB7Z1M9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C2CD4DB7Z1M9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
C2CD4DB7Z1M9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C2CD4DB7Z1M9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C2CD4DB7Z1M9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C2CD4DB7Z1M9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C2CD4DB7Z1M9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C2CD4DB7Z1M9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C2CD4DB7Z1M9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C2CD4DB7Z1M9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
C2CD4DB7Z1M9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C2CD4DB7Z1M9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
C2CD4DB7Z1M9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C2CD4DB7Z1M9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C2CD4DB7Z1M9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C2CD4DB7Z1M9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C2CD4DB7Z1M9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C2CD4DB7Z1M9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C2CD4DB7Z1M9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C2CD4DB7Z1M9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C2CD4DB7Z1M9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C2CD4DB7Z1M9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C2CD4DB7Z1M9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C2CD4DB7Z1M9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C2CD4DB7Z1M9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C2CD4DB7Z1M9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C2CD4DB7Z1M9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C2CD4DB7Z1M9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C2CD4DB7Z1M9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C2CD4DB7Z1M9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C2CD4DB7Z1M9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C2CD4DB7Z1M9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
C2CD4DB7Z1M9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C2CD4DB7Z1M9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C2CD4DB7Z1M9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C2CD4DB7Z1M9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
C2CD4DB7Z1M9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C2CD4DB7Z1M9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C2CD4DB7Z1M9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C2CD4DB7Z1M9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C2CD4DB7Z1M9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C2CD4DB7Z1M9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C2CD4DB7Z1M9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C2CD4DB7Z1M9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C2CD4DB7Z1M9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C2CD4DB7Z1M9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C2CD4DB7Z1M9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C2CD4DB7Z1M9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C2CD4DB7Z1M9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C2CD4DB7Z1M9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C2CD4DB7Z1M9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C2CD4DB7Z1M9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C2CD4DB7Z1M9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C2CD4DB7Z1M9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C2CD4DB7Z1M9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C2CD4DB7Z1M9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C2CD4DB7Z1M9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
C2CD4DB7Z1M9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C2CD4DB7Z1M9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C2CD4DB7Z1M9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
C2CD4DB7Z1M9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
C2CD4DB7Z1M9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
C2CD4DB7Z1M9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C2CD4DB7Z1M9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C2CD4DB7Z1M9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C2CD4DB7Z1M9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C2CD4DB7Z1M9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C2CD4DB7Z1M9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C2CD4DB7Z1M9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C2CD4DB7Z1M9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C2CD4DB7Z1M9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms