Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT87PA6NCN2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT87PA6NCN2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT87PA6NCN2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT87PA6NCN2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT87PA6NCN2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT87PA6NCN2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT87PA6NCN2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT87PA6NCN2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT87PA6NCN2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT87PA6NCN2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT87PA6NCN2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT87PA6NCN2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT87PA6NCN2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT87PA6NCN2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT87PA6NCN2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT87PA6NCN2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT87PA6NCN2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT87PA6NCN2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT87PA6NCN2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT87PA6NCN2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT87PA6NCN2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT87PA6NCN2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT87PA6NCN2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT87PA6NCN2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT87PA6NCN2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT87PA6NCN2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT87PA6NCN2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT87PA6NCN2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT87PA6NCN2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT87PA6NCN2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT87PA6NCN2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT87PA6NCN2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT87PA6NCN2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT87PA6NCN2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT87PA6NCN2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT87PA6NCN2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT87PA6NCN2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT87PA6NCN2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT87PA6NCN2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT87PA6NCN2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT87PA6NCN2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT87PA6NCN2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT87PA6NCN2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT87PA6NCN2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT87PA6NCN2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT87PA6NCN2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT87PA6NCN2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT87PA6NCN2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT87PA6NCN2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT87PA6NCN2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT87PA6NCN2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT87PA6NCN2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT87PA6NCN2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT87PA6NCN2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT87PA6NCN2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT87PA6NCN2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT87PA6NCN2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT87PA6NCN2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT87PA6NCN2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT87PA6NCN2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT87PA6NCN2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT87PA6NCN2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT87PA6NCN2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT87PA6NCN2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT87PA6NCN2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT87PA6NCN2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT87PA6NCN2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT87PA6NCN2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT87PA6NCN2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT87PA6NCN2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT87PA6NCN2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT87PA6NCN2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT87PA6NCN2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT87PA6NCN2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT87PA6NCN2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT87PA6NCN2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT87PA6NCN2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT87PA6NCN2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT87PA6NCN2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT87PA6NCN2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT87PA6NCN2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT87PA6NCN2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT87PA6NCN2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT87PA6NCN2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT87PA6NCN2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT87PA6NCN2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT87PA6NCN2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT87PA6NCN2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT87PA6NCN2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT87PA6NCN2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT87PA6NCN2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT87PA6NCN2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT87PA6NCN2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT87PA6NCN2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT87PA6NCN2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT87PA6NCN2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT87PA6NCN2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT87PA6NCN2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT87PA6NCN2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms