Protein–RNA interactions for Protein: A2VCK2

DCDC2B, Doublecortin domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC2BA2VCK2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DCDC2BA2VCK2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DCDC2BA2VCK2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DCDC2BA2VCK2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCDC2BA2VCK2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCDC2BA2VCK2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DCDC2BA2VCK2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DCDC2BA2VCK2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCDC2BA2VCK2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCDC2BA2VCK2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCDC2BA2VCK2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DCDC2BA2VCK2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCDC2BA2VCK2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCDC2BA2VCK2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCDC2BA2VCK2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCDC2BA2VCK2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCDC2BA2VCK2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCDC2BA2VCK2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCDC2BA2VCK2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCDC2BA2VCK2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCDC2BA2VCK2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCDC2BA2VCK2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DCDC2BA2VCK2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCDC2BA2VCK2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCDC2BA2VCK2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCDC2BA2VCK2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCDC2BA2VCK2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCDC2BA2VCK2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCDC2BA2VCK2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCDC2BA2VCK2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCDC2BA2VCK2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCDC2BA2VCK2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DCDC2BA2VCK2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCDC2BA2VCK2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCDC2BA2VCK2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCDC2BA2VCK2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DCDC2BA2VCK2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCDC2BA2VCK2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCDC2BA2VCK2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DCDC2BA2VCK2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCDC2BA2VCK2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCDC2BA2VCK2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCDC2BA2VCK2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCDC2BA2VCK2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCDC2BA2VCK2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCDC2BA2VCK2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCDC2BA2VCK2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DCDC2BA2VCK2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DCDC2BA2VCK2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DCDC2BA2VCK2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DCDC2BA2VCK2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DCDC2BA2VCK2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DCDC2BA2VCK2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DCDC2BA2VCK2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DCDC2BA2VCK2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DCDC2BA2VCK2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DCDC2BA2VCK2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DCDC2BA2VCK2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DCDC2BA2VCK2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
DCDC2BA2VCK2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCDC2BA2VCK2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCDC2BA2VCK2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCDC2BA2VCK2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCDC2BA2VCK2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCDC2BA2VCK2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCDC2BA2VCK2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCDC2BA2VCK2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCDC2BA2VCK2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCDC2BA2VCK2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCDC2BA2VCK2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCDC2BA2VCK2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCDC2BA2VCK2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCDC2BA2VCK2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCDC2BA2VCK2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCDC2BA2VCK2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCDC2BA2VCK2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCDC2BA2VCK2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCDC2BA2VCK2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCDC2BA2VCK2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCDC2BA2VCK2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCDC2BA2VCK2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCDC2BA2VCK2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCDC2BA2VCK2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCDC2BA2VCK2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCDC2BA2VCK2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCDC2BA2VCK2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCDC2BA2VCK2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCDC2BA2VCK2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCDC2BA2VCK2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCDC2BA2VCK2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DCDC2BA2VCK2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCDC2BA2VCK2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCDC2BA2VCK2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCDC2BA2VCK2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCDC2BA2VCK2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCDC2BA2VCK2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCDC2BA2VCK2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCDC2BA2VCK2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCDC2BA2VCK2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCDC2BA2VCK2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms