Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYCE3A1L190 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYCE3A1L190 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYCE3A1L190 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYCE3A1L190 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYCE3A1L190 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYCE3A1L190 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYCE3A1L190 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYCE3A1L190 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYCE3A1L190 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYCE3A1L190 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYCE3A1L190 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYCE3A1L190 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYCE3A1L190 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYCE3A1L190 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYCE3A1L190 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYCE3A1L190 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYCE3A1L190 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYCE3A1L190 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYCE3A1L190 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYCE3A1L190 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYCE3A1L190 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYCE3A1L190 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYCE3A1L190 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYCE3A1L190 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYCE3A1L190 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYCE3A1L190 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYCE3A1L190 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYCE3A1L190 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYCE3A1L190 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYCE3A1L190 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYCE3A1L190 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYCE3A1L190 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYCE3A1L190 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYCE3A1L190 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYCE3A1L190 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYCE3A1L190 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYCE3A1L190 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYCE3A1L190 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYCE3A1L190 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYCE3A1L190 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYCE3A1L190 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYCE3A1L190 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYCE3A1L190 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYCE3A1L190 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SYCE3A1L190 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYCE3A1L190 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYCE3A1L190 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYCE3A1L190 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYCE3A1L190 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYCE3A1L190 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYCE3A1L190 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SYCE3A1L190 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYCE3A1L190 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYCE3A1L190 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYCE3A1L190 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYCE3A1L190 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYCE3A1L190 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYCE3A1L190 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYCE3A1L190 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYCE3A1L190 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYCE3A1L190 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYCE3A1L190 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYCE3A1L190 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYCE3A1L190 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYCE3A1L190 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYCE3A1L190 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYCE3A1L190 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYCE3A1L190 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYCE3A1L190 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYCE3A1L190 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYCE3A1L190 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYCE3A1L190 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYCE3A1L190 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYCE3A1L190 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYCE3A1L190 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYCE3A1L190 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYCE3A1L190 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYCE3A1L190 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYCE3A1L190 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYCE3A1L190 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYCE3A1L190 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SYCE3A1L190 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SYCE3A1L190 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SYCE3A1L190 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SYCE3A1L190 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYCE3A1L190 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYCE3A1L190 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYCE3A1L190 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYCE3A1L190 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYCE3A1L190 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYCE3A1L190 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYCE3A1L190 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYCE3A1L190 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYCE3A1L190 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYCE3A1L190 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYCE3A1L190 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYCE3A1L190 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYCE3A1L190 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYCE3A1L190 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 828.2 ms