Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PAXBP1Q9Y5B6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PAXBP1Q9Y5B6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PAXBP1Q9Y5B6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PAXBP1Q9Y5B6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PAXBP1Q9Y5B6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PAXBP1Q9Y5B6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PAXBP1Q9Y5B6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PAXBP1Q9Y5B6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PAXBP1Q9Y5B6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PAXBP1Q9Y5B6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PAXBP1Q9Y5B6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PAXBP1Q9Y5B6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PAXBP1Q9Y5B6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PAXBP1Q9Y5B6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PAXBP1Q9Y5B6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PAXBP1Q9Y5B6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PAXBP1Q9Y5B6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PAXBP1Q9Y5B6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PAXBP1Q9Y5B6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PAXBP1Q9Y5B6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PAXBP1Q9Y5B6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PAXBP1Q9Y5B6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PAXBP1Q9Y5B6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PAXBP1Q9Y5B6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PAXBP1Q9Y5B6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PAXBP1Q9Y5B6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PAXBP1Q9Y5B6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PAXBP1Q9Y5B6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PAXBP1Q9Y5B6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PAXBP1Q9Y5B6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PAXBP1Q9Y5B6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PAXBP1Q9Y5B6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PAXBP1Q9Y5B6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PAXBP1Q9Y5B6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PAXBP1Q9Y5B6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PAXBP1Q9Y5B6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PAXBP1Q9Y5B6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PAXBP1Q9Y5B6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PAXBP1Q9Y5B6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PAXBP1Q9Y5B6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PAXBP1Q9Y5B6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PAXBP1Q9Y5B6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PAXBP1Q9Y5B6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PAXBP1Q9Y5B6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PAXBP1Q9Y5B6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PAXBP1Q9Y5B6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PAXBP1Q9Y5B6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PAXBP1Q9Y5B6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PAXBP1Q9Y5B6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PAXBP1Q9Y5B6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PAXBP1Q9Y5B6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PAXBP1Q9Y5B6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PAXBP1Q9Y5B6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PAXBP1Q9Y5B6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PAXBP1Q9Y5B6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PAXBP1Q9Y5B6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PAXBP1Q9Y5B6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PAXBP1Q9Y5B6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PAXBP1Q9Y5B6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PAXBP1Q9Y5B6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PAXBP1Q9Y5B6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PAXBP1Q9Y5B6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PAXBP1Q9Y5B6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PAXBP1Q9Y5B6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PAXBP1Q9Y5B6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PAXBP1Q9Y5B6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PAXBP1Q9Y5B6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PAXBP1Q9Y5B6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PAXBP1Q9Y5B6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PAXBP1Q9Y5B6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PAXBP1Q9Y5B6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PAXBP1Q9Y5B6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PAXBP1Q9Y5B6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PAXBP1Q9Y5B6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PAXBP1Q9Y5B6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PAXBP1Q9Y5B6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PAXBP1Q9Y5B6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PAXBP1Q9Y5B6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PAXBP1Q9Y5B6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PAXBP1Q9Y5B6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PAXBP1Q9Y5B6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PAXBP1Q9Y5B6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PAXBP1Q9Y5B6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PAXBP1Q9Y5B6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PAXBP1Q9Y5B6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PAXBP1Q9Y5B6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PAXBP1Q9Y5B6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PAXBP1Q9Y5B6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PAXBP1Q9Y5B6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PAXBP1Q9Y5B6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PAXBP1Q9Y5B6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PAXBP1Q9Y5B6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PAXBP1Q9Y5B6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PAXBP1Q9Y5B6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms