Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y597

KCTD3, BTB/POZ domain-containing protein KCTD3, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD3Q9Y597 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KCTD3Q9Y597 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCTD3Q9Y597 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCTD3Q9Y597 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KCTD3Q9Y597 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KCTD3Q9Y597 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCTD3Q9Y597 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCTD3Q9Y597 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCTD3Q9Y597 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCTD3Q9Y597 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCTD3Q9Y597 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCTD3Q9Y597 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCTD3Q9Y597 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KCTD3Q9Y597 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KCTD3Q9Y597 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCTD3Q9Y597 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCTD3Q9Y597 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCTD3Q9Y597 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCTD3Q9Y597 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCTD3Q9Y597 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCTD3Q9Y597 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCTD3Q9Y597 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCTD3Q9Y597 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCTD3Q9Y597 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCTD3Q9Y597 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCTD3Q9Y597 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KCTD3Q9Y597 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCTD3Q9Y597 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCTD3Q9Y597 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCTD3Q9Y597 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCTD3Q9Y597 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCTD3Q9Y597 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCTD3Q9Y597 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCTD3Q9Y597 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCTD3Q9Y597 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCTD3Q9Y597 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCTD3Q9Y597 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCTD3Q9Y597 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCTD3Q9Y597 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCTD3Q9Y597 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KCTD3Q9Y597 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCTD3Q9Y597 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCTD3Q9Y597 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCTD3Q9Y597 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCTD3Q9Y597 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCTD3Q9Y597 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCTD3Q9Y597 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCTD3Q9Y597 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
KCTD3Q9Y597 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
KCTD3Q9Y597 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCTD3Q9Y597 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCTD3Q9Y597 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCTD3Q9Y597 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCTD3Q9Y597 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCTD3Q9Y597 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCTD3Q9Y597 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCTD3Q9Y597 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCTD3Q9Y597 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCTD3Q9Y597 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCTD3Q9Y597 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCTD3Q9Y597 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCTD3Q9Y597 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCTD3Q9Y597 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCTD3Q9Y597 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCTD3Q9Y597 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCTD3Q9Y597 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCTD3Q9Y597 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCTD3Q9Y597 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCTD3Q9Y597 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCTD3Q9Y597 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCTD3Q9Y597 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCTD3Q9Y597 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCTD3Q9Y597 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCTD3Q9Y597 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCTD3Q9Y597 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCTD3Q9Y597 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCTD3Q9Y597 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCTD3Q9Y597 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCTD3Q9Y597 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCTD3Q9Y597 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCTD3Q9Y597 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCTD3Q9Y597 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCTD3Q9Y597 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCTD3Q9Y597 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCTD3Q9Y597 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCTD3Q9Y597 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCTD3Q9Y597 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCTD3Q9Y597 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCTD3Q9Y597 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KCTD3Q9Y597 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCTD3Q9Y597 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCTD3Q9Y597 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCTD3Q9Y597 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCTD3Q9Y597 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCTD3Q9Y597 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCTD3Q9Y597 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCTD3Q9Y597 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCTD3Q9Y597 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCTD3Q9Y597 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCTD3Q9Y597 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms