Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJK0

TSR3, Ribosome biogenesis protein TSR3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR3Q9UJK0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSR3Q9UJK0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSR3Q9UJK0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TSR3Q9UJK0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSR3Q9UJK0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TSR3Q9UJK0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSR3Q9UJK0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSR3Q9UJK0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSR3Q9UJK0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSR3Q9UJK0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSR3Q9UJK0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSR3Q9UJK0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSR3Q9UJK0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSR3Q9UJK0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSR3Q9UJK0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSR3Q9UJK0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSR3Q9UJK0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSR3Q9UJK0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSR3Q9UJK0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TSR3Q9UJK0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TSR3Q9UJK0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSR3Q9UJK0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSR3Q9UJK0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSR3Q9UJK0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TSR3Q9UJK0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSR3Q9UJK0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSR3Q9UJK0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSR3Q9UJK0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSR3Q9UJK0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TSR3Q9UJK0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TSR3Q9UJK0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TSR3Q9UJK0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TSR3Q9UJK0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TSR3Q9UJK0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TSR3Q9UJK0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TSR3Q9UJK0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSR3Q9UJK0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSR3Q9UJK0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TSR3Q9UJK0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSR3Q9UJK0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSR3Q9UJK0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSR3Q9UJK0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSR3Q9UJK0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSR3Q9UJK0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSR3Q9UJK0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSR3Q9UJK0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSR3Q9UJK0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSR3Q9UJK0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSR3Q9UJK0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSR3Q9UJK0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSR3Q9UJK0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSR3Q9UJK0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSR3Q9UJK0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSR3Q9UJK0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSR3Q9UJK0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSR3Q9UJK0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSR3Q9UJK0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSR3Q9UJK0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSR3Q9UJK0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSR3Q9UJK0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSR3Q9UJK0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSR3Q9UJK0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSR3Q9UJK0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSR3Q9UJK0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSR3Q9UJK0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSR3Q9UJK0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSR3Q9UJK0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSR3Q9UJK0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSR3Q9UJK0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSR3Q9UJK0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSR3Q9UJK0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSR3Q9UJK0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSR3Q9UJK0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSR3Q9UJK0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSR3Q9UJK0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSR3Q9UJK0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TSR3Q9UJK0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSR3Q9UJK0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSR3Q9UJK0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSR3Q9UJK0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSR3Q9UJK0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSR3Q9UJK0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSR3Q9UJK0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSR3Q9UJK0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSR3Q9UJK0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSR3Q9UJK0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSR3Q9UJK0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSR3Q9UJK0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSR3Q9UJK0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSR3Q9UJK0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSR3Q9UJK0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSR3Q9UJK0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSR3Q9UJK0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSR3Q9UJK0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TSR3Q9UJK0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSR3Q9UJK0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSR3Q9UJK0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TSR3Q9UJK0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSR3Q9UJK0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSR3Q9UJK0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1441.4 ms