Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X8

LINC00474, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00474, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00474Q9P2X8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00474Q9P2X8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00474Q9P2X8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00474Q9P2X8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00474Q9P2X8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00474Q9P2X8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00474Q9P2X8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00474Q9P2X8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms