Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A12Q9NXJ0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A12Q9NXJ0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A12Q9NXJ0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A12Q9NXJ0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A12Q9NXJ0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A12Q9NXJ0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A12Q9NXJ0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A12Q9NXJ0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A12Q9NXJ0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A12Q9NXJ0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A12Q9NXJ0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A12Q9NXJ0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A12Q9NXJ0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A12Q9NXJ0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A12Q9NXJ0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A12Q9NXJ0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A12Q9NXJ0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A12Q9NXJ0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A12Q9NXJ0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A12Q9NXJ0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A12Q9NXJ0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A12Q9NXJ0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A12Q9NXJ0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A12Q9NXJ0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A12Q9NXJ0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A12Q9NXJ0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A12Q9NXJ0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A12Q9NXJ0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A12Q9NXJ0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A12Q9NXJ0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A12Q9NXJ0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A12Q9NXJ0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MS4A12Q9NXJ0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A12Q9NXJ0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A12Q9NXJ0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A12Q9NXJ0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A12Q9NXJ0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A12Q9NXJ0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A12Q9NXJ0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A12Q9NXJ0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A12Q9NXJ0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A12Q9NXJ0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A12Q9NXJ0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A12Q9NXJ0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A12Q9NXJ0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A12Q9NXJ0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A12Q9NXJ0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A12Q9NXJ0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A12Q9NXJ0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A12Q9NXJ0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A12Q9NXJ0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A12Q9NXJ0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A12Q9NXJ0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A12Q9NXJ0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A12Q9NXJ0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A12Q9NXJ0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A12Q9NXJ0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A12Q9NXJ0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A12Q9NXJ0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A12Q9NXJ0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A12Q9NXJ0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A12Q9NXJ0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A12Q9NXJ0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A12Q9NXJ0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A12Q9NXJ0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A12Q9NXJ0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A12Q9NXJ0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A12Q9NXJ0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A12Q9NXJ0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A12Q9NXJ0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A12Q9NXJ0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A12Q9NXJ0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A12Q9NXJ0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A12Q9NXJ0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A12Q9NXJ0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A12Q9NXJ0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A12Q9NXJ0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A12Q9NXJ0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A12Q9NXJ0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A12Q9NXJ0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A12Q9NXJ0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A12Q9NXJ0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A12Q9NXJ0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A12Q9NXJ0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A12Q9NXJ0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A12Q9NXJ0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A12Q9NXJ0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A12Q9NXJ0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A12Q9NXJ0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A12Q9NXJ0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A12Q9NXJ0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A12Q9NXJ0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A12Q9NXJ0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A12Q9NXJ0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A12Q9NXJ0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A12Q9NXJ0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A12Q9NXJ0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A12Q9NXJ0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A12Q9NXJ0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms