Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR7

CCDC177, Coiled-coil domain-containing protein 177, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC177Q9NQR7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC177Q9NQR7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC177Q9NQR7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC177Q9NQR7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC177Q9NQR7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC177Q9NQR7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC177Q9NQR7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC177Q9NQR7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC177Q9NQR7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC177Q9NQR7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC177Q9NQR7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC177Q9NQR7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC177Q9NQR7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC177Q9NQR7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC177Q9NQR7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC177Q9NQR7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC177Q9NQR7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC177Q9NQR7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC177Q9NQR7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC177Q9NQR7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC177Q9NQR7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC177Q9NQR7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC177Q9NQR7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC177Q9NQR7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC177Q9NQR7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC177Q9NQR7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC177Q9NQR7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC177Q9NQR7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC177Q9NQR7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC177Q9NQR7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC177Q9NQR7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC177Q9NQR7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC177Q9NQR7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC177Q9NQR7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC177Q9NQR7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC177Q9NQR7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC177Q9NQR7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC177Q9NQR7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC177Q9NQR7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC177Q9NQR7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC177Q9NQR7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC177Q9NQR7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC177Q9NQR7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC177Q9NQR7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC177Q9NQR7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC177Q9NQR7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC177Q9NQR7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC177Q9NQR7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC177Q9NQR7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC177Q9NQR7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC177Q9NQR7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC177Q9NQR7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC177Q9NQR7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC177Q9NQR7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC177Q9NQR7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC177Q9NQR7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC177Q9NQR7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC177Q9NQR7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC177Q9NQR7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC177Q9NQR7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC177Q9NQR7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC177Q9NQR7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC177Q9NQR7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC177Q9NQR7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC177Q9NQR7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC177Q9NQR7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC177Q9NQR7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC177Q9NQR7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC177Q9NQR7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC177Q9NQR7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC177Q9NQR7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC177Q9NQR7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC177Q9NQR7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC177Q9NQR7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC177Q9NQR7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC177Q9NQR7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC177Q9NQR7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC177Q9NQR7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC177Q9NQR7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC177Q9NQR7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC177Q9NQR7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC177Q9NQR7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC177Q9NQR7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC177Q9NQR7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC177Q9NQR7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC177Q9NQR7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC177Q9NQR7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC177Q9NQR7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC177Q9NQR7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC177Q9NQR7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC177Q9NQR7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC177Q9NQR7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC177Q9NQR7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC177Q9NQR7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC177Q9NQR7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC177Q9NQR7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC177Q9NQR7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC177Q9NQR7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC177Q9NQR7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC177Q9NQR7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms