Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ71

PITPNM3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNM3Q9BZ71 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PITPNM3Q9BZ71 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PITPNM3Q9BZ71 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PITPNM3Q9BZ71 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PITPNM3Q9BZ71 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PITPNM3Q9BZ71 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PITPNM3Q9BZ71 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PITPNM3Q9BZ71 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PITPNM3Q9BZ71 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PITPNM3Q9BZ71 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PITPNM3Q9BZ71 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PITPNM3Q9BZ71 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PITPNM3Q9BZ71 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PITPNM3Q9BZ71 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PITPNM3Q9BZ71 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PITPNM3Q9BZ71 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PITPNM3Q9BZ71 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PITPNM3Q9BZ71 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PITPNM3Q9BZ71 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PITPNM3Q9BZ71 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PITPNM3Q9BZ71 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PITPNM3Q9BZ71 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PITPNM3Q9BZ71 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PITPNM3Q9BZ71 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PITPNM3Q9BZ71 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PITPNM3Q9BZ71 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PITPNM3Q9BZ71 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PITPNM3Q9BZ71 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PITPNM3Q9BZ71 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PITPNM3Q9BZ71 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PITPNM3Q9BZ71 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PITPNM3Q9BZ71 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PITPNM3Q9BZ71 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PITPNM3Q9BZ71 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PITPNM3Q9BZ71 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PITPNM3Q9BZ71 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PITPNM3Q9BZ71 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PITPNM3Q9BZ71 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PITPNM3Q9BZ71 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PITPNM3Q9BZ71 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PITPNM3Q9BZ71 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PITPNM3Q9BZ71 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PITPNM3Q9BZ71 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PITPNM3Q9BZ71 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PITPNM3Q9BZ71 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PITPNM3Q9BZ71 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PITPNM3Q9BZ71 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PITPNM3Q9BZ71 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PITPNM3Q9BZ71 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PITPNM3Q9BZ71 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PITPNM3Q9BZ71 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PITPNM3Q9BZ71 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PITPNM3Q9BZ71 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PITPNM3Q9BZ71 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PITPNM3Q9BZ71 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PITPNM3Q9BZ71 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PITPNM3Q9BZ71 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PITPNM3Q9BZ71 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PITPNM3Q9BZ71 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PITPNM3Q9BZ71 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PITPNM3Q9BZ71 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PITPNM3Q9BZ71 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PITPNM3Q9BZ71 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PITPNM3Q9BZ71 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PITPNM3Q9BZ71 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PITPNM3Q9BZ71 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PITPNM3Q9BZ71 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PITPNM3Q9BZ71 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PITPNM3Q9BZ71 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PITPNM3Q9BZ71 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PITPNM3Q9BZ71 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PITPNM3Q9BZ71 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PITPNM3Q9BZ71 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PITPNM3Q9BZ71 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PITPNM3Q9BZ71 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PITPNM3Q9BZ71 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PITPNM3Q9BZ71 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PITPNM3Q9BZ71 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PITPNM3Q9BZ71 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PITPNM3Q9BZ71 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PITPNM3Q9BZ71 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PITPNM3Q9BZ71 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PITPNM3Q9BZ71 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PITPNM3Q9BZ71 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PITPNM3Q9BZ71 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PITPNM3Q9BZ71 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PITPNM3Q9BZ71 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PITPNM3Q9BZ71 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PITPNM3Q9BZ71 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PITPNM3Q9BZ71 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PITPNM3Q9BZ71 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PITPNM3Q9BZ71 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PITPNM3Q9BZ71 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PITPNM3Q9BZ71 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PITPNM3Q9BZ71 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PITPNM3Q9BZ71 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PITPNM3Q9BZ71 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PITPNM3Q9BZ71 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PITPNM3Q9BZ71 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PITPNM3Q9BZ71 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.2 ms