Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC11.17□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.7 ms