Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC106Q9BWC9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC106Q9BWC9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC106Q9BWC9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC106Q9BWC9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC106Q9BWC9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC106Q9BWC9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC106Q9BWC9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC106Q9BWC9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC106Q9BWC9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC106Q9BWC9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC106Q9BWC9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC106Q9BWC9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC106Q9BWC9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC106Q9BWC9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC106Q9BWC9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC106Q9BWC9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC106Q9BWC9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC106Q9BWC9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC106Q9BWC9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC106Q9BWC9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC106Q9BWC9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC106Q9BWC9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC106Q9BWC9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC106Q9BWC9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC106Q9BWC9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC106Q9BWC9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC106Q9BWC9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC106Q9BWC9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC106Q9BWC9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC106Q9BWC9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC106Q9BWC9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC106Q9BWC9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC106Q9BWC9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC106Q9BWC9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC106Q9BWC9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC106Q9BWC9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC106Q9BWC9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC106Q9BWC9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC106Q9BWC9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC106Q9BWC9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC106Q9BWC9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC106Q9BWC9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC106Q9BWC9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC106Q9BWC9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC106Q9BWC9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC106Q9BWC9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC106Q9BWC9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC106Q9BWC9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC106Q9BWC9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC106Q9BWC9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC106Q9BWC9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC106Q9BWC9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC106Q9BWC9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC106Q9BWC9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC106Q9BWC9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC106Q9BWC9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC106Q9BWC9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC106Q9BWC9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC106Q9BWC9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC106Q9BWC9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC106Q9BWC9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC106Q9BWC9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC106Q9BWC9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC106Q9BWC9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC106Q9BWC9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC106Q9BWC9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC106Q9BWC9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC106Q9BWC9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC106Q9BWC9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC106Q9BWC9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC106Q9BWC9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC106Q9BWC9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC106Q9BWC9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC106Q9BWC9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC106Q9BWC9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC106Q9BWC9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC106Q9BWC9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC106Q9BWC9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC106Q9BWC9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC106Q9BWC9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC106Q9BWC9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC106Q9BWC9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC106Q9BWC9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC106Q9BWC9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC106Q9BWC9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC106Q9BWC9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC106Q9BWC9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC106Q9BWC9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC106Q9BWC9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC106Q9BWC9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC106Q9BWC9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC106Q9BWC9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC106Q9BWC9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC106Q9BWC9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC106Q9BWC9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC106Q9BWC9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC106Q9BWC9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC106Q9BWC9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC106Q9BWC9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms