Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3GL3Q99963 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3GL3Q99963 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3GL3Q99963 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3GL3Q99963 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3GL3Q99963 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3GL3Q99963 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3GL3Q99963 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3GL3Q99963 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3GL3Q99963 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3GL3Q99963 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3GL3Q99963 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3GL3Q99963 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3GL3Q99963 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3GL3Q99963 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3GL3Q99963 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3GL3Q99963 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3GL3Q99963 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3GL3Q99963 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3GL3Q99963 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3GL3Q99963 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3GL3Q99963 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3GL3Q99963 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3GL3Q99963 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3GL3Q99963 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3GL3Q99963 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3GL3Q99963 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3GL3Q99963 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3GL3Q99963 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3GL3Q99963 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3GL3Q99963 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3GL3Q99963 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3GL3Q99963 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3GL3Q99963 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3GL3Q99963 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3GL3Q99963 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3GL3Q99963 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3GL3Q99963 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3GL3Q99963 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3GL3Q99963 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3GL3Q99963 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3GL3Q99963 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3GL3Q99963 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3GL3Q99963 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3GL3Q99963 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3GL3Q99963 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3GL3Q99963 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3GL3Q99963 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3GL3Q99963 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3GL3Q99963 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3GL3Q99963 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3GL3Q99963 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3GL3Q99963 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3GL3Q99963 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3GL3Q99963 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3GL3Q99963 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3GL3Q99963 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3GL3Q99963 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3GL3Q99963 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3GL3Q99963 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3GL3Q99963 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3GL3Q99963 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3GL3Q99963 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3GL3Q99963 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3GL3Q99963 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3GL3Q99963 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3GL3Q99963 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3GL3Q99963 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3GL3Q99963 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3GL3Q99963 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3GL3Q99963 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3GL3Q99963 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3GL3Q99963 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3GL3Q99963 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3GL3Q99963 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3GL3Q99963 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3GL3Q99963 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3GL3Q99963 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3GL3Q99963 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3GL3Q99963 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3GL3Q99963 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3GL3Q99963 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3GL3Q99963 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3GL3Q99963 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3GL3Q99963 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3GL3Q99963 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3GL3Q99963 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3GL3Q99963 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3GL3Q99963 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3GL3Q99963 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3GL3Q99963 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3GL3Q99963 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3GL3Q99963 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3GL3Q99963 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3GL3Q99963 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3GL3Q99963 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3GL3Q99963 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3GL3Q99963 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3GL3Q99963 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3GL3Q99963 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms