Protein–RNA interactions for Protein: Q96KJ4

MSLNL, Mesothelin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNLQ96KJ4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSLNLQ96KJ4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSLNLQ96KJ4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSLNLQ96KJ4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSLNLQ96KJ4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MSLNLQ96KJ4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSLNLQ96KJ4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MSLNLQ96KJ4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSLNLQ96KJ4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSLNLQ96KJ4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSLNLQ96KJ4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSLNLQ96KJ4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSLNLQ96KJ4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSLNLQ96KJ4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSLNLQ96KJ4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSLNLQ96KJ4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSLNLQ96KJ4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSLNLQ96KJ4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSLNLQ96KJ4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSLNLQ96KJ4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSLNLQ96KJ4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSLNLQ96KJ4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSLNLQ96KJ4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MSLNLQ96KJ4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MSLNLQ96KJ4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MSLNLQ96KJ4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSLNLQ96KJ4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSLNLQ96KJ4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSLNLQ96KJ4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSLNLQ96KJ4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSLNLQ96KJ4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSLNLQ96KJ4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSLNLQ96KJ4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSLNLQ96KJ4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSLNLQ96KJ4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSLNLQ96KJ4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSLNLQ96KJ4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSLNLQ96KJ4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MSLNLQ96KJ4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MSLNLQ96KJ4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MSLNLQ96KJ4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MSLNLQ96KJ4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MSLNLQ96KJ4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MSLNLQ96KJ4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MSLNLQ96KJ4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MSLNLQ96KJ4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSLNLQ96KJ4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSLNLQ96KJ4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MSLNLQ96KJ4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSLNLQ96KJ4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSLNLQ96KJ4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSLNLQ96KJ4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MSLNLQ96KJ4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MSLNLQ96KJ4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MSLNLQ96KJ4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MSLNLQ96KJ4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MSLNLQ96KJ4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MSLNLQ96KJ4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MSLNLQ96KJ4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MSLNLQ96KJ4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MSLNLQ96KJ4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSLNLQ96KJ4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSLNLQ96KJ4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSLNLQ96KJ4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSLNLQ96KJ4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSLNLQ96KJ4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSLNLQ96KJ4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSLNLQ96KJ4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSLNLQ96KJ4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSLNLQ96KJ4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSLNLQ96KJ4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSLNLQ96KJ4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MSLNLQ96KJ4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSLNLQ96KJ4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSLNLQ96KJ4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSLNLQ96KJ4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSLNLQ96KJ4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MSLNLQ96KJ4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MSLNLQ96KJ4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MSLNLQ96KJ4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MSLNLQ96KJ4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MSLNLQ96KJ4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MSLNLQ96KJ4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MSLNLQ96KJ4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MSLNLQ96KJ4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MSLNLQ96KJ4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MSLNLQ96KJ4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MSLNLQ96KJ4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MSLNLQ96KJ4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MSLNLQ96KJ4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MSLNLQ96KJ4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MSLNLQ96KJ4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MSLNLQ96KJ4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MSLNLQ96KJ4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MSLNLQ96KJ4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MSLNLQ96KJ4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MSLNLQ96KJ4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MSLNLQ96KJ4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MSLNLQ96KJ4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MSLNLQ96KJ4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms