Protein–RNA interactions for Protein: Q96HD1

CRELD1, Cysteine-rich with EGF-like domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRELD1Q96HD1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRELD1Q96HD1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CRELD1Q96HD1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRELD1Q96HD1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRELD1Q96HD1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRELD1Q96HD1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRELD1Q96HD1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRELD1Q96HD1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRELD1Q96HD1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRELD1Q96HD1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRELD1Q96HD1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRELD1Q96HD1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRELD1Q96HD1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRELD1Q96HD1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRELD1Q96HD1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRELD1Q96HD1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CRELD1Q96HD1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRELD1Q96HD1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRELD1Q96HD1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRELD1Q96HD1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRELD1Q96HD1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRELD1Q96HD1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRELD1Q96HD1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRELD1Q96HD1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRELD1Q96HD1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRELD1Q96HD1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRELD1Q96HD1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRELD1Q96HD1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRELD1Q96HD1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRELD1Q96HD1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CRELD1Q96HD1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRELD1Q96HD1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRELD1Q96HD1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRELD1Q96HD1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRELD1Q96HD1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRELD1Q96HD1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRELD1Q96HD1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRELD1Q96HD1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRELD1Q96HD1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRELD1Q96HD1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRELD1Q96HD1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CRELD1Q96HD1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRELD1Q96HD1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRELD1Q96HD1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRELD1Q96HD1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRELD1Q96HD1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CRELD1Q96HD1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CRELD1Q96HD1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRELD1Q96HD1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRELD1Q96HD1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRELD1Q96HD1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRELD1Q96HD1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CRELD1Q96HD1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRELD1Q96HD1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CRELD1Q96HD1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRELD1Q96HD1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRELD1Q96HD1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRELD1Q96HD1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRELD1Q96HD1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRELD1Q96HD1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRELD1Q96HD1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRELD1Q96HD1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRELD1Q96HD1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRELD1Q96HD1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRELD1Q96HD1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRELD1Q96HD1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRELD1Q96HD1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRELD1Q96HD1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRELD1Q96HD1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRELD1Q96HD1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRELD1Q96HD1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CRELD1Q96HD1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CRELD1Q96HD1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRELD1Q96HD1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRELD1Q96HD1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CRELD1Q96HD1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRELD1Q96HD1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRELD1Q96HD1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRELD1Q96HD1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRELD1Q96HD1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRELD1Q96HD1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRELD1Q96HD1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CRELD1Q96HD1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRELD1Q96HD1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRELD1Q96HD1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CRELD1Q96HD1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRELD1Q96HD1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRELD1Q96HD1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRELD1Q96HD1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CRELD1Q96HD1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRELD1Q96HD1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRELD1Q96HD1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CRELD1Q96HD1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRELD1Q96HD1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRELD1Q96HD1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CRELD1Q96HD1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRELD1Q96HD1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRELD1Q96HD1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRELD1Q96HD1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRELD1Q96HD1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.5 ms