Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKD1Q969G9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NKD1Q969G9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKD1Q969G9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKD1Q969G9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKD1Q969G9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKD1Q969G9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKD1Q969G9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKD1Q969G9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKD1Q969G9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKD1Q969G9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKD1Q969G9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NKD1Q969G9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKD1Q969G9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NKD1Q969G9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKD1Q969G9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKD1Q969G9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKD1Q969G9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKD1Q969G9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKD1Q969G9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKD1Q969G9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKD1Q969G9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKD1Q969G9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKD1Q969G9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKD1Q969G9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKD1Q969G9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKD1Q969G9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKD1Q969G9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NKD1Q969G9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKD1Q969G9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKD1Q969G9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKD1Q969G9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKD1Q969G9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NKD1Q969G9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NKD1Q969G9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NKD1Q969G9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NKD1Q969G9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NKD1Q969G9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NKD1Q969G9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NKD1Q969G9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NKD1Q969G9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKD1Q969G9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NKD1Q969G9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NKD1Q969G9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKD1Q969G9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKD1Q969G9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKD1Q969G9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKD1Q969G9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKD1Q969G9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKD1Q969G9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKD1Q969G9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKD1Q969G9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NKD1Q969G9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKD1Q969G9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NKD1Q969G9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKD1Q969G9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKD1Q969G9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKD1Q969G9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NKD1Q969G9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKD1Q969G9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKD1Q969G9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKD1Q969G9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKD1Q969G9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKD1Q969G9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKD1Q969G9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKD1Q969G9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKD1Q969G9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKD1Q969G9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKD1Q969G9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKD1Q969G9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKD1Q969G9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKD1Q969G9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKD1Q969G9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKD1Q969G9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKD1Q969G9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKD1Q969G9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NKD1Q969G9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKD1Q969G9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKD1Q969G9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKD1Q969G9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKD1Q969G9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKD1Q969G9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKD1Q969G9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKD1Q969G9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NKD1Q969G9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKD1Q969G9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NKD1Q969G9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKD1Q969G9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKD1Q969G9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKD1Q969G9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKD1Q969G9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKD1Q969G9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKD1Q969G9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKD1Q969G9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKD1Q969G9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKD1Q969G9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKD1Q969G9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKD1Q969G9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NKD1Q969G9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NKD1Q969G9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms